Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC153Q494R4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC153Q494R4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC153Q494R4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC153Q494R4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC153Q494R4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC153Q494R4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC153Q494R4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC153Q494R4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC153Q494R4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC153Q494R4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC153Q494R4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC153Q494R4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC153Q494R4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC153Q494R4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC153Q494R4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC153Q494R4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC153Q494R4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC153Q494R4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC153Q494R4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC153Q494R4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC153Q494R4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC153Q494R4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC153Q494R4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC153Q494R4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC153Q494R4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC153Q494R4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC153Q494R4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC153Q494R4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC153Q494R4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC153Q494R4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC153Q494R4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC153Q494R4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC153Q494R4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC153Q494R4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC153Q494R4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC153Q494R4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC153Q494R4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC153Q494R4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC153Q494R4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC153Q494R4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC153Q494R4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC153Q494R4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC153Q494R4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC153Q494R4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC153Q494R4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC153Q494R4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC153Q494R4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC153Q494R4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC153Q494R4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC153Q494R4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC153Q494R4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC153Q494R4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC153Q494R4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC153Q494R4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC153Q494R4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC153Q494R4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC153Q494R4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC153Q494R4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC153Q494R4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC153Q494R4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC153Q494R4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC153Q494R4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC153Q494R4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC153Q494R4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC153Q494R4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC153Q494R4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC153Q494R4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC153Q494R4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC153Q494R4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC153Q494R4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC153Q494R4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC153Q494R4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC153Q494R4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC153Q494R4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC153Q494R4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC153Q494R4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC153Q494R4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC153Q494R4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC153Q494R4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC153Q494R4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC153Q494R4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC153Q494R4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC153Q494R4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC153Q494R4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC153Q494R4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC153Q494R4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC153Q494R4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC153Q494R4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC153Q494R4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC153Q494R4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC153Q494R4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC153Q494R4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC153Q494R4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC153Q494R4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC153Q494R4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC153Q494R4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC153Q494R4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC153Q494R4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC153Q494R4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms