Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SP6Q3SY56 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SP6Q3SY56 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SP6Q3SY56 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SP6Q3SY56 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SP6Q3SY56 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SP6Q3SY56 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SP6Q3SY56 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SP6Q3SY56 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SP6Q3SY56 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SP6Q3SY56 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SP6Q3SY56 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SP6Q3SY56 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SP6Q3SY56 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SP6Q3SY56 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SP6Q3SY56 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SP6Q3SY56 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SP6Q3SY56 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SP6Q3SY56 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SP6Q3SY56 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SP6Q3SY56 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SP6Q3SY56 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SP6Q3SY56 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SP6Q3SY56 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms