Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXY7

LRIT3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 679 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT3Q3SXY7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LRIT3Q3SXY7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRIT3Q3SXY7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LRIT3Q3SXY7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRIT3Q3SXY7 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LRIT3Q3SXY7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LRIT3Q3SXY7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRIT3Q3SXY7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LRIT3Q3SXY7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LRIT3Q3SXY7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRIT3Q3SXY7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRIT3Q3SXY7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LRIT3Q3SXY7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRIT3Q3SXY7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRIT3Q3SXY7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRIT3Q3SXY7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LRIT3Q3SXY7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRIT3Q3SXY7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRIT3Q3SXY7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRIT3Q3SXY7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRIT3Q3SXY7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LRIT3Q3SXY7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LRIT3Q3SXY7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRIT3Q3SXY7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRIT3Q3SXY7 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRIT3Q3SXY7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LRIT3Q3SXY7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRIT3Q3SXY7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRIT3Q3SXY7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
LRIT3Q3SXY7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRIT3Q3SXY7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRIT3Q3SXY7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRIT3Q3SXY7 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LRIT3Q3SXY7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LRIT3Q3SXY7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRIT3Q3SXY7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRIT3Q3SXY7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRIT3Q3SXY7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRIT3Q3SXY7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRIT3Q3SXY7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRIT3Q3SXY7 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRIT3Q3SXY7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRIT3Q3SXY7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRIT3Q3SXY7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRIT3Q3SXY7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRIT3Q3SXY7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRIT3Q3SXY7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRIT3Q3SXY7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRIT3Q3SXY7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRIT3Q3SXY7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRIT3Q3SXY7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRIT3Q3SXY7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRIT3Q3SXY7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRIT3Q3SXY7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRIT3Q3SXY7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRIT3Q3SXY7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRIT3Q3SXY7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRIT3Q3SXY7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRIT3Q3SXY7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRIT3Q3SXY7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRIT3Q3SXY7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRIT3Q3SXY7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRIT3Q3SXY7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRIT3Q3SXY7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRIT3Q3SXY7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRIT3Q3SXY7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRIT3Q3SXY7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRIT3Q3SXY7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRIT3Q3SXY7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRIT3Q3SXY7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRIT3Q3SXY7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRIT3Q3SXY7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRIT3Q3SXY7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRIT3Q3SXY7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRIT3Q3SXY7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRIT3Q3SXY7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRIT3Q3SXY7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LRIT3Q3SXY7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRIT3Q3SXY7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRIT3Q3SXY7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRIT3Q3SXY7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRIT3Q3SXY7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LRIT3Q3SXY7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRIT3Q3SXY7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
LRIT3Q3SXY7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRIT3Q3SXY7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRIT3Q3SXY7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRIT3Q3SXY7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRIT3Q3SXY7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRIT3Q3SXY7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRIT3Q3SXY7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRIT3Q3SXY7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRIT3Q3SXY7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
LRIT3Q3SXY7 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRIT3Q3SXY7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRIT3Q3SXY7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRIT3Q3SXY7 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRIT3Q3SXY7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRIT3Q3SXY7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRIT3Q3SXY7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
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