Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI77

KRTAP13-4, Keratin-associated protein 13-4, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-4Q3LI77 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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KRTAP13-4Q3LI77 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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KRTAP13-4Q3LI77 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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KRTAP13-4Q3LI77 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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KRTAP13-4Q3LI77 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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KRTAP13-4Q3LI77 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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KRTAP13-4Q3LI77 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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KRTAP13-4Q3LI77 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP13-4Q3LI77 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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