Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI66

KRTAP6-2, Keratin-associated protein 6-2, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP6-2Q3LI66 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
KRTAP6-2Q3LI66 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms