Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
NBPF1Q3BBV0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
NBPF1Q3BBV0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
NBPF1Q3BBV0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
NBPF1Q3BBV0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
NBPF1Q3BBV0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
NBPF1Q3BBV0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
NBPF1Q3BBV0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
NBPF1Q3BBV0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
NBPF1Q3BBV0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
NBPF1Q3BBV0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
NBPF1Q3BBV0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
NBPF1Q3BBV0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
NBPF1Q3BBV0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
NBPF1Q3BBV0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
NBPF1Q3BBV0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
NBPF1Q3BBV0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
NBPF1Q3BBV0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
NBPF1Q3BBV0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
NBPF1Q3BBV0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
NBPF1Q3BBV0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
NBPF1Q3BBV0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
NBPF1Q3BBV0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
NBPF1Q3BBV0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
NBPF1Q3BBV0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
NBPF1Q3BBV0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
NBPF1Q3BBV0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
NBPF1Q3BBV0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
NBPF1Q3BBV0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
NBPF1Q3BBV0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
NBPF1Q3BBV0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
NBPF1Q3BBV0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
NBPF1Q3BBV0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
NBPF1Q3BBV0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
NBPF1Q3BBV0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NBPF1Q3BBV0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NBPF1Q3BBV0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NBPF1Q3BBV0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
NBPF1Q3BBV0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NBPF1Q3BBV0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
NBPF1Q3BBV0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
NBPF1Q3BBV0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
NBPF1Q3BBV0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
NBPF1Q3BBV0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NBPF1Q3BBV0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NBPF1Q3BBV0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NBPF1Q3BBV0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NBPF1Q3BBV0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NBPF1Q3BBV0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NBPF1Q3BBV0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NBPF1Q3BBV0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
NBPF1Q3BBV0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
NBPF1Q3BBV0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
NBPF1Q3BBV0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
NBPF1Q3BBV0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
NBPF1Q3BBV0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
NBPF1Q3BBV0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NBPF1Q3BBV0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
NBPF1Q3BBV0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
NBPF1Q3BBV0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
NBPF1Q3BBV0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NBPF1Q3BBV0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
NBPF1Q3BBV0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NBPF1Q3BBV0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NBPF1Q3BBV0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
NBPF1Q3BBV0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NBPF1Q3BBV0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NBPF1Q3BBV0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NBPF1Q3BBV0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NBPF1Q3BBV0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NBPF1Q3BBV0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NBPF1Q3BBV0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NBPF1Q3BBV0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NBPF1Q3BBV0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NBPF1Q3BBV0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NBPF1Q3BBV0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
NBPF1Q3BBV0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NBPF1Q3BBV0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
NBPF1Q3BBV0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
NBPF1Q3BBV0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
NBPF1Q3BBV0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
NBPF1Q3BBV0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NBPF1Q3BBV0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NBPF1Q3BBV0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NBPF1Q3BBV0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NBPF1Q3BBV0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
NBPF1Q3BBV0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NBPF1Q3BBV0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NBPF1Q3BBV0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NBPF1Q3BBV0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NBPF1Q3BBV0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
NBPF1Q3BBV0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NBPF1Q3BBV0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NBPF1Q3BBV0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NBPF1Q3BBV0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
NBPF1Q3BBV0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
NBPF1Q3BBV0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
NBPF1Q3BBV0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NBPF1Q3BBV0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
NBPF1Q3BBV0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms