Protein–RNA interactions for Protein: Q32NC0

C18orf21, UPF0711 protein C18orf21, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf21Q32NC0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C18orf21Q32NC0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
C18orf21Q32NC0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C18orf21Q32NC0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C18orf21Q32NC0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C18orf21Q32NC0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C18orf21Q32NC0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C18orf21Q32NC0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C18orf21Q32NC0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C18orf21Q32NC0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C18orf21Q32NC0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C18orf21Q32NC0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C18orf21Q32NC0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C18orf21Q32NC0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C18orf21Q32NC0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C18orf21Q32NC0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C18orf21Q32NC0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C18orf21Q32NC0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C18orf21Q32NC0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C18orf21Q32NC0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C18orf21Q32NC0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C18orf21Q32NC0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C18orf21Q32NC0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C18orf21Q32NC0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C18orf21Q32NC0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C18orf21Q32NC0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C18orf21Q32NC0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C18orf21Q32NC0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C18orf21Q32NC0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C18orf21Q32NC0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C18orf21Q32NC0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C18orf21Q32NC0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C18orf21Q32NC0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C18orf21Q32NC0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C18orf21Q32NC0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
C18orf21Q32NC0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C18orf21Q32NC0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C18orf21Q32NC0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C18orf21Q32NC0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C18orf21Q32NC0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C18orf21Q32NC0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C18orf21Q32NC0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C18orf21Q32NC0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C18orf21Q32NC0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C18orf21Q32NC0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C18orf21Q32NC0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C18orf21Q32NC0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C18orf21Q32NC0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C18orf21Q32NC0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C18orf21Q32NC0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C18orf21Q32NC0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C18orf21Q32NC0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C18orf21Q32NC0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C18orf21Q32NC0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C18orf21Q32NC0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C18orf21Q32NC0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C18orf21Q32NC0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C18orf21Q32NC0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C18orf21Q32NC0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C18orf21Q32NC0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C18orf21Q32NC0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C18orf21Q32NC0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C18orf21Q32NC0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C18orf21Q32NC0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C18orf21Q32NC0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C18orf21Q32NC0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C18orf21Q32NC0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
C18orf21Q32NC0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C18orf21Q32NC0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C18orf21Q32NC0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C18orf21Q32NC0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C18orf21Q32NC0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C18orf21Q32NC0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C18orf21Q32NC0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
C18orf21Q32NC0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C18orf21Q32NC0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C18orf21Q32NC0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C18orf21Q32NC0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C18orf21Q32NC0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C18orf21Q32NC0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C18orf21Q32NC0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C18orf21Q32NC0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C18orf21Q32NC0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C18orf21Q32NC0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
C18orf21Q32NC0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C18orf21Q32NC0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C18orf21Q32NC0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C18orf21Q32NC0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C18orf21Q32NC0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C18orf21Q32NC0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C18orf21Q32NC0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C18orf21Q32NC0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C18orf21Q32NC0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C18orf21Q32NC0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C18orf21Q32NC0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C18orf21Q32NC0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
C18orf21Q32NC0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C18orf21Q32NC0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C18orf21Q32NC0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C18orf21Q32NC0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms