Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM71Q2Q1W2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM71Q2Q1W2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM71Q2Q1W2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM71Q2Q1W2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM71Q2Q1W2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM71Q2Q1W2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM71Q2Q1W2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM71Q2Q1W2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM71Q2Q1W2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM71Q2Q1W2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRIM71Q2Q1W2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM71Q2Q1W2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM71Q2Q1W2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM71Q2Q1W2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM71Q2Q1W2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM71Q2Q1W2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM71Q2Q1W2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM71Q2Q1W2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM71Q2Q1W2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM71Q2Q1W2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM71Q2Q1W2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM71Q2Q1W2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM71Q2Q1W2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM71Q2Q1W2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM71Q2Q1W2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM71Q2Q1W2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM71Q2Q1W2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM71Q2Q1W2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM71Q2Q1W2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM71Q2Q1W2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM71Q2Q1W2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM71Q2Q1W2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM71Q2Q1W2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM71Q2Q1W2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM71Q2Q1W2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM71Q2Q1W2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM71Q2Q1W2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM71Q2Q1W2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM71Q2Q1W2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM71Q2Q1W2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM71Q2Q1W2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM71Q2Q1W2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM71Q2Q1W2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM71Q2Q1W2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM71Q2Q1W2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM71Q2Q1W2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM71Q2Q1W2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM71Q2Q1W2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM71Q2Q1W2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM71Q2Q1W2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM71Q2Q1W2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM71Q2Q1W2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM71Q2Q1W2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM71Q2Q1W2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM71Q2Q1W2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM71Q2Q1W2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM71Q2Q1W2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM71Q2Q1W2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM71Q2Q1W2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM71Q2Q1W2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM71Q2Q1W2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM71Q2Q1W2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM71Q2Q1W2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM71Q2Q1W2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM71Q2Q1W2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM71Q2Q1W2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM71Q2Q1W2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM71Q2Q1W2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM71Q2Q1W2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM71Q2Q1W2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM71Q2Q1W2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM71Q2Q1W2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM71Q2Q1W2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM71Q2Q1W2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM71Q2Q1W2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM71Q2Q1W2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM71Q2Q1W2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM71Q2Q1W2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM71Q2Q1W2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM71Q2Q1W2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM71Q2Q1W2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM71Q2Q1W2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM71Q2Q1W2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRIM71Q2Q1W2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM71Q2Q1W2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM71Q2Q1W2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM71Q2Q1W2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM71Q2Q1W2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM71Q2Q1W2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM71Q2Q1W2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM71Q2Q1W2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM71Q2Q1W2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM71Q2Q1W2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM71Q2Q1W2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM71Q2Q1W2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM71Q2Q1W2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM71Q2Q1W2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM71Q2Q1W2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM71Q2Q1W2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms