Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NRF1Q16656 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NRF1Q16656 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NRF1Q16656 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NRF1Q16656 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NRF1Q16656 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRF1Q16656 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRF1Q16656 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRF1Q16656 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRF1Q16656 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRF1Q16656 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRF1Q16656 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRF1Q16656 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRF1Q16656 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRF1Q16656 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRF1Q16656 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRF1Q16656 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRF1Q16656 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRF1Q16656 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRF1Q16656 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRF1Q16656 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRF1Q16656 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRF1Q16656 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRF1Q16656 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NRF1Q16656 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NRF1Q16656 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NRF1Q16656 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NRF1Q16656 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NRF1Q16656 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NRF1Q16656 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NRF1Q16656 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NRF1Q16656 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NRF1Q16656 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NRF1Q16656 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NRF1Q16656 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NRF1Q16656 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NRF1Q16656 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NRF1Q16656 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NRF1Q16656 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NRF1Q16656 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NRF1Q16656 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NRF1Q16656 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NRF1Q16656 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NRF1Q16656 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NRF1Q16656 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NRF1Q16656 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NRF1Q16656 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NRF1Q16656 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NRF1Q16656 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NRF1Q16656 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NRF1Q16656 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NRF1Q16656 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NRF1Q16656 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NRF1Q16656 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NRF1Q16656 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NRF1Q16656 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NRF1Q16656 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NRF1Q16656 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NRF1Q16656 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NRF1Q16656 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NRF1Q16656 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NRF1Q16656 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NRF1Q16656 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NRF1Q16656 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NRF1Q16656 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NRF1Q16656 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NRF1Q16656 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NRF1Q16656 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NRF1Q16656 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NRF1Q16656 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NRF1Q16656 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NRF1Q16656 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NRF1Q16656 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NRF1Q16656 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NRF1Q16656 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NRF1Q16656 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NRF1Q16656 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NRF1Q16656 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NRF1Q16656 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NRF1Q16656 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NRF1Q16656 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NRF1Q16656 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NRF1Q16656 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NRF1Q16656 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NRF1Q16656 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NRF1Q16656 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NRF1Q16656 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NRF1Q16656 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NRF1Q16656 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NRF1Q16656 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NRF1Q16656 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NRF1Q16656 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NRF1Q16656 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NRF1Q16656 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NRF1Q16656 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NRF1Q16656 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NRF1Q16656 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NRF1Q16656 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NRF1Q16656 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NRF1Q16656 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92 ms