Protein–RNA interactions for Protein: Q16594

TAF9, Transcription initiation factor TFIID subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF9Q16594 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TAF9Q16594 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TAF9Q16594 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TAF9Q16594 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TAF9Q16594 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TAF9Q16594 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TAF9Q16594 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TAF9Q16594 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TAF9Q16594 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TAF9Q16594 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TAF9Q16594 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TAF9Q16594 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TAF9Q16594 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TAF9Q16594 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TAF9Q16594 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TAF9Q16594 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TAF9Q16594 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TAF9Q16594 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TAF9Q16594 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TAF9Q16594 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
TAF9Q16594 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TAF9Q16594 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF9Q16594 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF9Q16594 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF9Q16594 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF9Q16594 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF9Q16594 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF9Q16594 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF9Q16594 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF9Q16594 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF9Q16594 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF9Q16594 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF9Q16594 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF9Q16594 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF9Q16594 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF9Q16594 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF9Q16594 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF9Q16594 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF9Q16594 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF9Q16594 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF9Q16594 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF9Q16594 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF9Q16594 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF9Q16594 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF9Q16594 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF9Q16594 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF9Q16594 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF9Q16594 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF9Q16594 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF9Q16594 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF9Q16594 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF9Q16594 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF9Q16594 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF9Q16594 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF9Q16594 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF9Q16594 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF9Q16594 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF9Q16594 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF9Q16594 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF9Q16594 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF9Q16594 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF9Q16594 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF9Q16594 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF9Q16594 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF9Q16594 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF9Q16594 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF9Q16594 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF9Q16594 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF9Q16594 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF9Q16594 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF9Q16594 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TAF9Q16594 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TAF9Q16594 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TAF9Q16594 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TAF9Q16594 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TAF9Q16594 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TAF9Q16594 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TAF9Q16594 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TAF9Q16594 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TAF9Q16594 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TAF9Q16594 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TAF9Q16594 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TAF9Q16594 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TAF9Q16594 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TAF9Q16594 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TAF9Q16594 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TAF9Q16594 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TAF9Q16594 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TAF9Q16594 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TAF9Q16594 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TAF9Q16594 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TAF9Q16594 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TAF9Q16594 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TAF9Q16594 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TAF9Q16594 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TAF9Q16594 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TAF9Q16594 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TAF9Q16594 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TAF9Q16594 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TAF9Q16594 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms