Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBBP7Q16576 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBBP7Q16576 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBBP7Q16576 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBBP7Q16576 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBBP7Q16576 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBBP7Q16576 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RBBP7Q16576 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RBBP7Q16576 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RBBP7Q16576 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBBP7Q16576 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBBP7Q16576 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBBP7Q16576 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBBP7Q16576 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBBP7Q16576 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBBP7Q16576 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBBP7Q16576 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBBP7Q16576 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBBP7Q16576 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBBP7Q16576 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBBP7Q16576 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBBP7Q16576 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBBP7Q16576 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBBP7Q16576 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBBP7Q16576 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBBP7Q16576 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBBP7Q16576 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBBP7Q16576 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBBP7Q16576 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBBP7Q16576 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBBP7Q16576 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBBP7Q16576 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBBP7Q16576 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBBP7Q16576 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBBP7Q16576 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBBP7Q16576 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBBP7Q16576 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBBP7Q16576 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBBP7Q16576 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBBP7Q16576 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBBP7Q16576 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBBP7Q16576 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RBBP7Q16576 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBBP7Q16576 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBBP7Q16576 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBBP7Q16576 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBBP7Q16576 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBBP7Q16576 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBBP7Q16576 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBBP7Q16576 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBBP7Q16576 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBBP7Q16576 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBBP7Q16576 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBBP7Q16576 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBBP7Q16576 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBBP7Q16576 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBBP7Q16576 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBBP7Q16576 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBBP7Q16576 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBBP7Q16576 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBBP7Q16576 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBBP7Q16576 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBBP7Q16576 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBBP7Q16576 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RBBP7Q16576 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RBBP7Q16576 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RBBP7Q16576 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RBBP7Q16576 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBBP7Q16576 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBBP7Q16576 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBBP7Q16576 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBBP7Q16576 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBBP7Q16576 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBBP7Q16576 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBBP7Q16576 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBBP7Q16576 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBBP7Q16576 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBBP7Q16576 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBBP7Q16576 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBBP7Q16576 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBBP7Q16576 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBBP7Q16576 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBBP7Q16576 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBBP7Q16576 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBBP7Q16576 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RBBP7Q16576 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBBP7Q16576 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBBP7Q16576 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBBP7Q16576 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBBP7Q16576 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBBP7Q16576 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBBP7Q16576 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBBP7Q16576 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBBP7Q16576 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBBP7Q16576 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBBP7Q16576 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBBP7Q16576 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBBP7Q16576 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBBP7Q16576 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBBP7Q16576 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms