Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRY1Q16526 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRY1Q16526 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRY1Q16526 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CRY1Q16526 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRY1Q16526 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CRY1Q16526 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRY1Q16526 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRY1Q16526 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CRY1Q16526 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CRY1Q16526 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRY1Q16526 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRY1Q16526 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRY1Q16526 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRY1Q16526 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRY1Q16526 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRY1Q16526 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CRY1Q16526 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CRY1Q16526 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CRY1Q16526 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CRY1Q16526 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRY1Q16526 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRY1Q16526 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRY1Q16526 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRY1Q16526 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRY1Q16526 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRY1Q16526 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRY1Q16526 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRY1Q16526 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRY1Q16526 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRY1Q16526 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRY1Q16526 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRY1Q16526 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRY1Q16526 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRY1Q16526 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRY1Q16526 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRY1Q16526 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRY1Q16526 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRY1Q16526 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRY1Q16526 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRY1Q16526 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRY1Q16526 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRY1Q16526 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRY1Q16526 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRY1Q16526 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRY1Q16526 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRY1Q16526 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRY1Q16526 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CRY1Q16526 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRY1Q16526 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRY1Q16526 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRY1Q16526 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRY1Q16526 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRY1Q16526 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRY1Q16526 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRY1Q16526 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRY1Q16526 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRY1Q16526 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRY1Q16526 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRY1Q16526 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRY1Q16526 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRY1Q16526 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRY1Q16526 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRY1Q16526 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRY1Q16526 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CRY1Q16526 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRY1Q16526 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRY1Q16526 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRY1Q16526 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRY1Q16526 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRY1Q16526 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRY1Q16526 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRY1Q16526 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRY1Q16526 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRY1Q16526 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRY1Q16526 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRY1Q16526 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRY1Q16526 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRY1Q16526 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRY1Q16526 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRY1Q16526 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CRY1Q16526 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRY1Q16526 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRY1Q16526 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRY1Q16526 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CRY1Q16526 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CRY1Q16526 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRY1Q16526 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRY1Q16526 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRY1Q16526 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRY1Q16526 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRY1Q16526 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRY1Q16526 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRY1Q16526 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRY1Q16526 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRY1Q16526 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRY1Q16526 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRY1Q16526 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRY1Q16526 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRY1Q16526 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
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