Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCD2Q16342 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCD2Q16342 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCD2Q16342 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCD2Q16342 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCD2Q16342 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCD2Q16342 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCD2Q16342 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCD2Q16342 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCD2Q16342 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCD2Q16342 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCD2Q16342 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCD2Q16342 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PDCD2Q16342 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCD2Q16342 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCD2Q16342 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCD2Q16342 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCD2Q16342 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCD2Q16342 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCD2Q16342 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCD2Q16342 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCD2Q16342 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCD2Q16342 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCD2Q16342 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCD2Q16342 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCD2Q16342 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCD2Q16342 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDCD2Q16342 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDCD2Q16342 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDCD2Q16342 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCD2Q16342 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCD2Q16342 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCD2Q16342 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCD2Q16342 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCD2Q16342 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCD2Q16342 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCD2Q16342 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCD2Q16342 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCD2Q16342 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCD2Q16342 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCD2Q16342 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCD2Q16342 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCD2Q16342 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCD2Q16342 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCD2Q16342 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCD2Q16342 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCD2Q16342 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCD2Q16342 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCD2Q16342 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCD2Q16342 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCD2Q16342 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCD2Q16342 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCD2Q16342 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCD2Q16342 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCD2Q16342 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCD2Q16342 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCD2Q16342 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCD2Q16342 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCD2Q16342 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCD2Q16342 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCD2Q16342 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCD2Q16342 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCD2Q16342 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCD2Q16342 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCD2Q16342 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCD2Q16342 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCD2Q16342 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCD2Q16342 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCD2Q16342 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCD2Q16342 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCD2Q16342 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCD2Q16342 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCD2Q16342 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCD2Q16342 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDCD2Q16342 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDCD2Q16342 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDCD2Q16342 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDCD2Q16342 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDCD2Q16342 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDCD2Q16342 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCD2Q16342 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCD2Q16342 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCD2Q16342 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCD2Q16342 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCD2Q16342 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCD2Q16342 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCD2Q16342 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCD2Q16342 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCD2Q16342 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCD2Q16342 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCD2Q16342 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCD2Q16342 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCD2Q16342 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCD2Q16342 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCD2Q16342 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCD2Q16342 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCD2Q16342 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCD2Q16342 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCD2Q16342 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCD2Q16342 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms