Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
E2F4Q16254 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
E2F4Q16254 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
E2F4Q16254 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
E2F4Q16254 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
E2F4Q16254 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
E2F4Q16254 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
E2F4Q16254 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
E2F4Q16254 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
E2F4Q16254 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
E2F4Q16254 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
E2F4Q16254 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
E2F4Q16254 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
E2F4Q16254 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
E2F4Q16254 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
E2F4Q16254 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
E2F4Q16254 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
E2F4Q16254 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
E2F4Q16254 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
E2F4Q16254 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
E2F4Q16254 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
E2F4Q16254 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
E2F4Q16254 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
E2F4Q16254 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
E2F4Q16254 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
E2F4Q16254 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
E2F4Q16254 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
E2F4Q16254 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
E2F4Q16254 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
E2F4Q16254 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
E2F4Q16254 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
E2F4Q16254 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
E2F4Q16254 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
E2F4Q16254 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
E2F4Q16254 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
E2F4Q16254 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
E2F4Q16254 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
E2F4Q16254 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
E2F4Q16254 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
E2F4Q16254 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
E2F4Q16254 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
E2F4Q16254 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
E2F4Q16254 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
E2F4Q16254 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
E2F4Q16254 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
E2F4Q16254 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
E2F4Q16254 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
E2F4Q16254 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
E2F4Q16254 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
E2F4Q16254 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
E2F4Q16254 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
E2F4Q16254 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
E2F4Q16254 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
E2F4Q16254 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
E2F4Q16254 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
E2F4Q16254 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
E2F4Q16254 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
E2F4Q16254 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
E2F4Q16254 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
E2F4Q16254 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
E2F4Q16254 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
E2F4Q16254 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
E2F4Q16254 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
E2F4Q16254 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
E2F4Q16254 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
E2F4Q16254 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
E2F4Q16254 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
E2F4Q16254 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
E2F4Q16254 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
E2F4Q16254 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
E2F4Q16254 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
E2F4Q16254 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
E2F4Q16254 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
E2F4Q16254 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
E2F4Q16254 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
E2F4Q16254 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
E2F4Q16254 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
E2F4Q16254 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
E2F4Q16254 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
E2F4Q16254 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
E2F4Q16254 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
E2F4Q16254 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
E2F4Q16254 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
E2F4Q16254 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
E2F4Q16254 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
E2F4Q16254 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
E2F4Q16254 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
E2F4Q16254 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
E2F4Q16254 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
E2F4Q16254 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
E2F4Q16254 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
E2F4Q16254 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
E2F4Q16254 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
E2F4Q16254 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
E2F4Q16254 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
E2F4Q16254 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
E2F4Q16254 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
E2F4Q16254 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
E2F4Q16254 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
E2F4Q16254 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
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