Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USF2Q15853 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
USF2Q15853 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USF2Q15853 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
USF2Q15853 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
USF2Q15853 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USF2Q15853 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USF2Q15853 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USF2Q15853 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
USF2Q15853 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
USF2Q15853 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
USF2Q15853 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USF2Q15853 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
USF2Q15853 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
USF2Q15853 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
USF2Q15853 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USF2Q15853 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
USF2Q15853 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USF2Q15853 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
USF2Q15853 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USF2Q15853 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
USF2Q15853 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
USF2Q15853 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USF2Q15853 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USF2Q15853 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USF2Q15853 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USF2Q15853 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USF2Q15853 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USF2Q15853 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USF2Q15853 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USF2Q15853 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USF2Q15853 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USF2Q15853 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USF2Q15853 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USF2Q15853 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USF2Q15853 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USF2Q15853 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USF2Q15853 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USF2Q15853 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USF2Q15853 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USF2Q15853 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USF2Q15853 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USF2Q15853 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USF2Q15853 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USF2Q15853 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USF2Q15853 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USF2Q15853 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USF2Q15853 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USF2Q15853 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USF2Q15853 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USF2Q15853 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USF2Q15853 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USF2Q15853 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USF2Q15853 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USF2Q15853 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USF2Q15853 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USF2Q15853 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USF2Q15853 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USF2Q15853 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USF2Q15853 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USF2Q15853 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USF2Q15853 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USF2Q15853 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USF2Q15853 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
USF2Q15853 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USF2Q15853 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USF2Q15853 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USF2Q15853 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USF2Q15853 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USF2Q15853 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USF2Q15853 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USF2Q15853 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USF2Q15853 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USF2Q15853 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USF2Q15853 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USF2Q15853 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USF2Q15853 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USF2Q15853 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
USF2Q15853 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USF2Q15853 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USF2Q15853 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USF2Q15853 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USF2Q15853 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USF2Q15853 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USF2Q15853 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USF2Q15853 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USF2Q15853 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USF2Q15853 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USF2Q15853 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USF2Q15853 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USF2Q15853 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USF2Q15853 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USF2Q15853 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USF2Q15853 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USF2Q15853 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USF2Q15853 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USF2Q15853 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USF2Q15853 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USF2Q15853 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USF2Q15853 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
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