Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF11Q15544 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF11Q15544 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF11Q15544 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF11Q15544 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF11Q15544 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF11Q15544 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF11Q15544 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF11Q15544 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF11Q15544 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF11Q15544 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF11Q15544 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF11Q15544 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF11Q15544 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF11Q15544 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF11Q15544 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF11Q15544 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF11Q15544 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF11Q15544 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF11Q15544 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF11Q15544 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF11Q15544 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF11Q15544 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF11Q15544 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF11Q15544 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF11Q15544 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF11Q15544 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF11Q15544 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF11Q15544 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF11Q15544 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TAF11Q15544 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TAF11Q15544 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TAF11Q15544 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF11Q15544 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF11Q15544 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF11Q15544 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF11Q15544 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF11Q15544 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF11Q15544 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF11Q15544 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF11Q15544 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF11Q15544 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF11Q15544 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF11Q15544 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF11Q15544 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF11Q15544 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF11Q15544 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF11Q15544 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF11Q15544 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF11Q15544 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF11Q15544 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF11Q15544 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF11Q15544 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF11Q15544 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF11Q15544 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF11Q15544 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF11Q15544 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF11Q15544 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF11Q15544 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF11Q15544 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF11Q15544 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF11Q15544 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF11Q15544 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF11Q15544 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF11Q15544 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF11Q15544 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF11Q15544 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF11Q15544 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF11Q15544 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF11Q15544 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF11Q15544 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF11Q15544 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF11Q15544 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF11Q15544 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF11Q15544 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF11Q15544 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF11Q15544 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF11Q15544 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF11Q15544 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF11Q15544 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF11Q15544 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF11Q15544 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF11Q15544 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF11Q15544 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF11Q15544 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF11Q15544 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF11Q15544 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF11Q15544 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF11Q15544 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF11Q15544 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TAF11Q15544 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TAF11Q15544 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF11Q15544 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF11Q15544 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF11Q15544 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF11Q15544 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF11Q15544 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF11Q15544 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF11Q15544 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF11Q15544 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms