Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYCP1Q15431 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYCP1Q15431 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYCP1Q15431 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYCP1Q15431 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYCP1Q15431 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYCP1Q15431 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYCP1Q15431 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYCP1Q15431 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYCP1Q15431 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYCP1Q15431 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYCP1Q15431 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SYCP1Q15431 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYCP1Q15431 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYCP1Q15431 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYCP1Q15431 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYCP1Q15431 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYCP1Q15431 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYCP1Q15431 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYCP1Q15431 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYCP1Q15431 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SYCP1Q15431 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYCP1Q15431 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYCP1Q15431 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYCP1Q15431 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYCP1Q15431 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYCP1Q15431 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYCP1Q15431 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYCP1Q15431 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYCP1Q15431 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYCP1Q15431 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SYCP1Q15431 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYCP1Q15431 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYCP1Q15431 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SYCP1Q15431 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYCP1Q15431 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYCP1Q15431 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYCP1Q15431 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYCP1Q15431 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYCP1Q15431 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYCP1Q15431 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYCP1Q15431 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYCP1Q15431 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYCP1Q15431 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYCP1Q15431 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYCP1Q15431 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYCP1Q15431 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYCP1Q15431 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYCP1Q15431 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYCP1Q15431 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYCP1Q15431 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYCP1Q15431 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYCP1Q15431 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYCP1Q15431 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYCP1Q15431 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYCP1Q15431 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYCP1Q15431 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYCP1Q15431 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYCP1Q15431 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SYCP1Q15431 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYCP1Q15431 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYCP1Q15431 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYCP1Q15431 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYCP1Q15431 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYCP1Q15431 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYCP1Q15431 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYCP1Q15431 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYCP1Q15431 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYCP1Q15431 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYCP1Q15431 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYCP1Q15431 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYCP1Q15431 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYCP1Q15431 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SYCP1Q15431 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYCP1Q15431 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYCP1Q15431 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYCP1Q15431 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYCP1Q15431 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYCP1Q15431 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYCP1Q15431 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SYCP1Q15431 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYCP1Q15431 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYCP1Q15431 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYCP1Q15431 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYCP1Q15431 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYCP1Q15431 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYCP1Q15431 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYCP1Q15431 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYCP1Q15431 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYCP1Q15431 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYCP1Q15431 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYCP1Q15431 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYCP1Q15431 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYCP1Q15431 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYCP1Q15431 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SYCP1Q15431 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SYCP1Q15431 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SYCP1Q15431 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SYCP1Q15431 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYCP1Q15431 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
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