Protein–RNA interactions for Protein: Q15370

ELOB, Elongin-B, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELOBQ15370 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ELOBQ15370 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ELOBQ15370 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ELOBQ15370 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ELOBQ15370 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ELOBQ15370 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ELOBQ15370 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ELOBQ15370 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ELOBQ15370 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ELOBQ15370 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ELOBQ15370 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELOBQ15370 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELOBQ15370 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELOBQ15370 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELOBQ15370 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELOBQ15370 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELOBQ15370 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELOBQ15370 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELOBQ15370 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELOBQ15370 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELOBQ15370 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELOBQ15370 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ELOBQ15370 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELOBQ15370 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELOBQ15370 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELOBQ15370 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELOBQ15370 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELOBQ15370 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELOBQ15370 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELOBQ15370 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELOBQ15370 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELOBQ15370 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELOBQ15370 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELOBQ15370 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELOBQ15370 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELOBQ15370 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELOBQ15370 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELOBQ15370 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELOBQ15370 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELOBQ15370 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELOBQ15370 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELOBQ15370 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELOBQ15370 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELOBQ15370 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELOBQ15370 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELOBQ15370 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELOBQ15370 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELOBQ15370 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELOBQ15370 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELOBQ15370 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELOBQ15370 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELOBQ15370 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELOBQ15370 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELOBQ15370 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELOBQ15370 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELOBQ15370 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELOBQ15370 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELOBQ15370 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELOBQ15370 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELOBQ15370 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELOBQ15370 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ELOBQ15370 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ELOBQ15370 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ELOBQ15370 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ELOBQ15370 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ELOBQ15370 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ELOBQ15370 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ELOBQ15370 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ELOBQ15370 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ELOBQ15370 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ELOBQ15370 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ELOBQ15370 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ELOBQ15370 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ELOBQ15370 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ELOBQ15370 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ELOBQ15370 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ELOBQ15370 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ELOBQ15370 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ELOBQ15370 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ELOBQ15370 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ELOBQ15370 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ELOBQ15370 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ELOBQ15370 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ELOBQ15370 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ELOBQ15370 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ELOBQ15370 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ELOBQ15370 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ELOBQ15370 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ELOBQ15370 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ELOBQ15370 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ELOBQ15370 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ELOBQ15370 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ELOBQ15370 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ELOBQ15370 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ELOBQ15370 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ELOBQ15370 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ELOBQ15370 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ELOBQ15370 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ELOBQ15370 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ELOBQ15370 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms