Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKD1Q15139 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKD1Q15139 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKD1Q15139 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKD1Q15139 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKD1Q15139 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKD1Q15139 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKD1Q15139 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKD1Q15139 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKD1Q15139 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKD1Q15139 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKD1Q15139 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKD1Q15139 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKD1Q15139 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKD1Q15139 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKD1Q15139 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKD1Q15139 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKD1Q15139 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKD1Q15139 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKD1Q15139 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKD1Q15139 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKD1Q15139 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKD1Q15139 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKD1Q15139 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKD1Q15139 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKD1Q15139 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKD1Q15139 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKD1Q15139 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKD1Q15139 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKD1Q15139 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKD1Q15139 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKD1Q15139 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKD1Q15139 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKD1Q15139 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKD1Q15139 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKD1Q15139 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKD1Q15139 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKD1Q15139 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKD1Q15139 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKD1Q15139 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKD1Q15139 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKD1Q15139 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKD1Q15139 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKD1Q15139 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKD1Q15139 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKD1Q15139 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKD1Q15139 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKD1Q15139 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKD1Q15139 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKD1Q15139 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKD1Q15139 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKD1Q15139 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKD1Q15139 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKD1Q15139 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKD1Q15139 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKD1Q15139 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKD1Q15139 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKD1Q15139 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKD1Q15139 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKD1Q15139 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKD1Q15139 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKD1Q15139 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKD1Q15139 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKD1Q15139 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKD1Q15139 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKD1Q15139 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKD1Q15139 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKD1Q15139 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKD1Q15139 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKD1Q15139 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKD1Q15139 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRKD1Q15139 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKD1Q15139 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKD1Q15139 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKD1Q15139 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKD1Q15139 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKD1Q15139 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKD1Q15139 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKD1Q15139 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKD1Q15139 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKD1Q15139 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKD1Q15139 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKD1Q15139 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKD1Q15139 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKD1Q15139 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKD1Q15139 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKD1Q15139 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKD1Q15139 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKD1Q15139 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKD1Q15139 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKD1Q15139 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKD1Q15139 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKD1Q15139 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKD1Q15139 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKD1Q15139 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKD1Q15139 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKD1Q15139 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKD1Q15139 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKD1Q15139 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKD1Q15139 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
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