Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDCD1Q15116 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDCD1Q15116 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDCD1Q15116 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDCD1Q15116 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDCD1Q15116 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDCD1Q15116 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDCD1Q15116 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDCD1Q15116 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDCD1Q15116 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDCD1Q15116 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDCD1Q15116 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDCD1Q15116 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDCD1Q15116 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDCD1Q15116 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDCD1Q15116 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDCD1Q15116 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDCD1Q15116 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PDCD1Q15116 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDCD1Q15116 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDCD1Q15116 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDCD1Q15116 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDCD1Q15116 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDCD1Q15116 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDCD1Q15116 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDCD1Q15116 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PDCD1Q15116 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PDCD1Q15116 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDCD1Q15116 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDCD1Q15116 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDCD1Q15116 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDCD1Q15116 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDCD1Q15116 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDCD1Q15116 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PDCD1Q15116 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDCD1Q15116 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDCD1Q15116 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDCD1Q15116 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDCD1Q15116 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDCD1Q15116 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDCD1Q15116 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDCD1Q15116 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDCD1Q15116 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDCD1Q15116 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDCD1Q15116 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDCD1Q15116 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDCD1Q15116 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDCD1Q15116 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDCD1Q15116 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDCD1Q15116 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDCD1Q15116 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDCD1Q15116 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDCD1Q15116 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDCD1Q15116 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDCD1Q15116 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDCD1Q15116 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDCD1Q15116 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDCD1Q15116 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDCD1Q15116 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDCD1Q15116 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDCD1Q15116 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDCD1Q15116 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDCD1Q15116 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDCD1Q15116 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDCD1Q15116 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDCD1Q15116 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDCD1Q15116 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDCD1Q15116 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDCD1Q15116 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDCD1Q15116 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDCD1Q15116 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDCD1Q15116 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDCD1Q15116 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDCD1Q15116 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDCD1Q15116 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDCD1Q15116 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDCD1Q15116 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDCD1Q15116 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDCD1Q15116 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDCD1Q15116 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDCD1Q15116 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PDCD1Q15116 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDCD1Q15116 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDCD1Q15116 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PDCD1Q15116 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDCD1Q15116 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDCD1Q15116 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PDCD1Q15116 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDCD1Q15116 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDCD1Q15116 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDCD1Q15116 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDCD1Q15116 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDCD1Q15116 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDCD1Q15116 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDCD1Q15116 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDCD1Q15116 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDCD1Q15116 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDCD1Q15116 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDCD1Q15116 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDCD1Q15116 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
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