Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SHPRHQ149N8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SHPRHQ149N8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SHPRHQ149N8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
SHPRHQ149N8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
SHPRHQ149N8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC32■■■□□ 2.71
SHPRHQ149N8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC32■■■□□ 2.71
SHPRHQ149N8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
SHPRHQ149N8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
SHPRHQ149N8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
SHPRHQ149N8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
SHPRHQ149N8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SHPRHQ149N8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SHPRHQ149N8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SHPRHQ149N8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SHPRHQ149N8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SHPRHQ149N8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SHPRHQ149N8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SHPRHQ149N8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SHPRHQ149N8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SHPRHQ149N8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SHPRHQ149N8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SHPRHQ149N8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SHPRHQ149N8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SHPRHQ149N8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SHPRHQ149N8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SHPRHQ149N8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
SHPRHQ149N8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SHPRHQ149N8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SHPRHQ149N8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SHPRHQ149N8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SHPRHQ149N8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SHPRHQ149N8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SHPRHQ149N8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
SHPRHQ149N8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SHPRHQ149N8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SHPRHQ149N8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SHPRHQ149N8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SHPRHQ149N8 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
SHPRHQ149N8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SHPRHQ149N8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
SHPRHQ149N8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SHPRHQ149N8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
SHPRHQ149N8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
SHPRHQ149N8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
SHPRHQ149N8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
SHPRHQ149N8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.7
SHPRHQ149N8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
SHPRHQ149N8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
SHPRHQ149N8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SHPRHQ149N8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SHPRHQ149N8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SHPRHQ149N8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SHPRHQ149N8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SHPRHQ149N8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
SHPRHQ149N8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
SHPRHQ149N8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
SHPRHQ149N8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
SHPRHQ149N8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
SHPRHQ149N8 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC31.93■■■□□ 2.7
SHPRHQ149N8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
SHPRHQ149N8 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
SHPRHQ149N8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
SHPRHQ149N8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
SHPRHQ149N8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
SHPRHQ149N8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
SHPRHQ149N8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
SHPRHQ149N8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
SHPRHQ149N8 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
SHPRHQ149N8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
SHPRHQ149N8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
SHPRHQ149N8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
SHPRHQ149N8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
SHPRHQ149N8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
SHPRHQ149N8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
SHPRHQ149N8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
SHPRHQ149N8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
SHPRHQ149N8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
SHPRHQ149N8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
SHPRHQ149N8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC31.89■■■□□ 2.7
SHPRHQ149N8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
SHPRHQ149N8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
SHPRHQ149N8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
SHPRHQ149N8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
SHPRHQ149N8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
SHPRHQ149N8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
SHPRHQ149N8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
SHPRHQ149N8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
SHPRHQ149N8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
SHPRHQ149N8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
SHPRHQ149N8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
SHPRHQ149N8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.86■■■□□ 2.69
SHPRHQ149N8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
SHPRHQ149N8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
SHPRHQ149N8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
SHPRHQ149N8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
SHPRHQ149N8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
SHPRHQ149N8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
SHPRHQ149N8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
SHPRHQ149N8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
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