Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMC1AQ14683 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMC1AQ14683 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMC1AQ14683 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMC1AQ14683 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMC1AQ14683 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMC1AQ14683 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMC1AQ14683 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMC1AQ14683 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMC1AQ14683 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMC1AQ14683 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMC1AQ14683 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMC1AQ14683 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMC1AQ14683 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMC1AQ14683 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMC1AQ14683 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMC1AQ14683 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMC1AQ14683 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMC1AQ14683 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMC1AQ14683 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMC1AQ14683 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMC1AQ14683 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMC1AQ14683 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMC1AQ14683 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMC1AQ14683 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SMC1AQ14683 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMC1AQ14683 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMC1AQ14683 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMC1AQ14683 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMC1AQ14683 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMC1AQ14683 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMC1AQ14683 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMC1AQ14683 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMC1AQ14683 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMC1AQ14683 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMC1AQ14683 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMC1AQ14683 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMC1AQ14683 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMC1AQ14683 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMC1AQ14683 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMC1AQ14683 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMC1AQ14683 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMC1AQ14683 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMC1AQ14683 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMC1AQ14683 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMC1AQ14683 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMC1AQ14683 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMC1AQ14683 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMC1AQ14683 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMC1AQ14683 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMC1AQ14683 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMC1AQ14683 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMC1AQ14683 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMC1AQ14683 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SMC1AQ14683 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMC1AQ14683 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMC1AQ14683 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMC1AQ14683 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMC1AQ14683 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMC1AQ14683 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMC1AQ14683 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMC1AQ14683 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMC1AQ14683 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMC1AQ14683 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMC1AQ14683 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMC1AQ14683 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMC1AQ14683 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMC1AQ14683 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMC1AQ14683 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMC1AQ14683 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMC1AQ14683 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMC1AQ14683 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMC1AQ14683 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMC1AQ14683 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMC1AQ14683 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMC1AQ14683 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMC1AQ14683 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMC1AQ14683 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMC1AQ14683 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMC1AQ14683 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMC1AQ14683 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMC1AQ14683 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMC1AQ14683 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMC1AQ14683 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMC1AQ14683 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMC1AQ14683 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMC1AQ14683 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMC1AQ14683 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMC1AQ14683 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMC1AQ14683 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMC1AQ14683 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMC1AQ14683 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMC1AQ14683 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SMC1AQ14683 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SMC1AQ14683 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SMC1AQ14683 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMC1AQ14683 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SMC1AQ14683 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMC1AQ14683 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMC1AQ14683 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
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