Protein–RNA interactions for Protein: Q14574

DSC3, Desmocollin-3, humanhuman

Predictions only

Length 896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC3Q14574 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DSC3Q14574 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DSC3Q14574 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DSC3Q14574 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
DSC3Q14574 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
DSC3Q14574 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
DSC3Q14574 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DSC3Q14574 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DSC3Q14574 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DSC3Q14574 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DSC3Q14574 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DSC3Q14574 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
DSC3Q14574 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DSC3Q14574 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DSC3Q14574 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DSC3Q14574 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DSC3Q14574 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DSC3Q14574 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DSC3Q14574 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DSC3Q14574 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DSC3Q14574 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DSC3Q14574 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DSC3Q14574 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
DSC3Q14574 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DSC3Q14574 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DSC3Q14574 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DSC3Q14574 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DSC3Q14574 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
DSC3Q14574 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
DSC3Q14574 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DSC3Q14574 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
DSC3Q14574 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
DSC3Q14574 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DSC3Q14574 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DSC3Q14574 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DSC3Q14574 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DSC3Q14574 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DSC3Q14574 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DSC3Q14574 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DSC3Q14574 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DSC3Q14574 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DSC3Q14574 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
DSC3Q14574 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DSC3Q14574 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
DSC3Q14574 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DSC3Q14574 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DSC3Q14574 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DSC3Q14574 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DSC3Q14574 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DSC3Q14574 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DSC3Q14574 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DSC3Q14574 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DSC3Q14574 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DSC3Q14574 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DSC3Q14574 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DSC3Q14574 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DSC3Q14574 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DSC3Q14574 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DSC3Q14574 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DSC3Q14574 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DSC3Q14574 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DSC3Q14574 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DSC3Q14574 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DSC3Q14574 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DSC3Q14574 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DSC3Q14574 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DSC3Q14574 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DSC3Q14574 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DSC3Q14574 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
DSC3Q14574 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DSC3Q14574 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DSC3Q14574 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DSC3Q14574 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DSC3Q14574 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DSC3Q14574 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DSC3Q14574 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DSC3Q14574 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DSC3Q14574 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DSC3Q14574 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DSC3Q14574 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
DSC3Q14574 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DSC3Q14574 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
DSC3Q14574 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DSC3Q14574 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DSC3Q14574 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DSC3Q14574 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DSC3Q14574 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DSC3Q14574 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DSC3Q14574 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
DSC3Q14574 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
DSC3Q14574 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
DSC3Q14574 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DSC3Q14574 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DSC3Q14574 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DSC3Q14574 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DSC3Q14574 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DSC3Q14574 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DSC3Q14574 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DSC3Q14574 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DSC3Q14574 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms