Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA3AQ14563 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA3AQ14563 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA3AQ14563 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA3AQ14563 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA3AQ14563 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA3AQ14563 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA3AQ14563 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA3AQ14563 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA3AQ14563 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA3AQ14563 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA3AQ14563 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA3AQ14563 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA3AQ14563 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA3AQ14563 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA3AQ14563 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA3AQ14563 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA3AQ14563 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA3AQ14563 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA3AQ14563 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA3AQ14563 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA3AQ14563 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA3AQ14563 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA3AQ14563 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA3AQ14563 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA3AQ14563 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA3AQ14563 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA3AQ14563 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA3AQ14563 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA3AQ14563 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA3AQ14563 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA3AQ14563 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA3AQ14563 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA3AQ14563 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA3AQ14563 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA3AQ14563 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA3AQ14563 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA3AQ14563 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA3AQ14563 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA3AQ14563 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA3AQ14563 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA3AQ14563 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA3AQ14563 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA3AQ14563 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA3AQ14563 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA3AQ14563 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA3AQ14563 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA3AQ14563 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA3AQ14563 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA3AQ14563 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA3AQ14563 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA3AQ14563 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA3AQ14563 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA3AQ14563 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA3AQ14563 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA3AQ14563 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA3AQ14563 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA3AQ14563 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA3AQ14563 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA3AQ14563 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA3AQ14563 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA3AQ14563 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA3AQ14563 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA3AQ14563 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA3AQ14563 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA3AQ14563 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3AQ14563 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3AQ14563 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3AQ14563 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3AQ14563 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3AQ14563 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3AQ14563 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3AQ14563 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3AQ14563 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3AQ14563 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3AQ14563 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3AQ14563 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3AQ14563 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3AQ14563 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3AQ14563 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3AQ14563 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA3AQ14563 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA3AQ14563 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA3AQ14563 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA3AQ14563 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA3AQ14563 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA3AQ14563 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA3AQ14563 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA3AQ14563 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA3AQ14563 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SEMA3AQ14563 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SEMA3AQ14563 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA3AQ14563 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA3AQ14563 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA3AQ14563 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA3AQ14563 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA3AQ14563 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA3AQ14563 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA3AQ14563 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA3AQ14563 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
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