Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEDD9Q14511 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NEDD9Q14511 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NEDD9Q14511 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEDD9Q14511 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NEDD9Q14511 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEDD9Q14511 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEDD9Q14511 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEDD9Q14511 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEDD9Q14511 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEDD9Q14511 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEDD9Q14511 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEDD9Q14511 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEDD9Q14511 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEDD9Q14511 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEDD9Q14511 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NEDD9Q14511 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEDD9Q14511 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEDD9Q14511 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEDD9Q14511 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEDD9Q14511 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEDD9Q14511 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEDD9Q14511 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEDD9Q14511 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEDD9Q14511 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEDD9Q14511 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEDD9Q14511 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEDD9Q14511 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEDD9Q14511 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEDD9Q14511 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEDD9Q14511 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEDD9Q14511 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEDD9Q14511 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEDD9Q14511 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEDD9Q14511 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEDD9Q14511 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEDD9Q14511 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEDD9Q14511 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEDD9Q14511 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEDD9Q14511 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEDD9Q14511 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEDD9Q14511 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEDD9Q14511 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NEDD9Q14511 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEDD9Q14511 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEDD9Q14511 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEDD9Q14511 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEDD9Q14511 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEDD9Q14511 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEDD9Q14511 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEDD9Q14511 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEDD9Q14511 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEDD9Q14511 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEDD9Q14511 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEDD9Q14511 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NEDD9Q14511 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEDD9Q14511 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEDD9Q14511 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEDD9Q14511 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NEDD9Q14511 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEDD9Q14511 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEDD9Q14511 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEDD9Q14511 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NEDD9Q14511 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEDD9Q14511 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEDD9Q14511 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEDD9Q14511 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NEDD9Q14511 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEDD9Q14511 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEDD9Q14511 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEDD9Q14511 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NEDD9Q14511 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEDD9Q14511 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEDD9Q14511 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEDD9Q14511 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEDD9Q14511 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEDD9Q14511 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEDD9Q14511 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEDD9Q14511 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEDD9Q14511 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEDD9Q14511 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEDD9Q14511 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEDD9Q14511 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEDD9Q14511 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEDD9Q14511 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEDD9Q14511 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEDD9Q14511 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEDD9Q14511 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEDD9Q14511 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEDD9Q14511 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEDD9Q14511 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEDD9Q14511 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEDD9Q14511 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEDD9Q14511 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEDD9Q14511 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEDD9Q14511 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEDD9Q14511 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEDD9Q14511 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NEDD9Q14511 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEDD9Q14511 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
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