Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
BECN1Q14457 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
BECN1Q14457 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
BECN1Q14457 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BECN1Q14457 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
BECN1Q14457 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BECN1Q14457 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BECN1Q14457 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BECN1Q14457 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
BECN1Q14457 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BECN1Q14457 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
BECN1Q14457 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
BECN1Q14457 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BECN1Q14457 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
BECN1Q14457 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BECN1Q14457 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
BECN1Q14457 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BECN1Q14457 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
BECN1Q14457 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BECN1Q14457 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BECN1Q14457 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BECN1Q14457 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
BECN1Q14457 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
BECN1Q14457 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC27.53■■■□□ 2
BECN1Q14457 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
BECN1Q14457 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BECN1Q14457 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
BECN1Q14457 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BECN1Q14457 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BECN1Q14457 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BECN1Q14457 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BECN1Q14457 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BECN1Q14457 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
BECN1Q14457 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
BECN1Q14457 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BECN1Q14457 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BECN1Q14457 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
BECN1Q14457 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
BECN1Q14457 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
BECN1Q14457 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
BECN1Q14457 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BECN1Q14457 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BECN1Q14457 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BECN1Q14457 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BECN1Q14457 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BECN1Q14457 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BECN1Q14457 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BECN1Q14457 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BECN1Q14457 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BECN1Q14457 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BECN1Q14457 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BECN1Q14457 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BECN1Q14457 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BECN1Q14457 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BECN1Q14457 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BECN1Q14457 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BECN1Q14457 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BECN1Q14457 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
BECN1Q14457 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BECN1Q14457 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BECN1Q14457 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BECN1Q14457 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BECN1Q14457 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BECN1Q14457 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BECN1Q14457 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BECN1Q14457 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BECN1Q14457 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BECN1Q14457 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BECN1Q14457 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BECN1Q14457 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BECN1Q14457 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BECN1Q14457 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BECN1Q14457 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BECN1Q14457 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BECN1Q14457 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BECN1Q14457 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BECN1Q14457 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BECN1Q14457 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BECN1Q14457 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BECN1Q14457 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BECN1Q14457 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BECN1Q14457 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BECN1Q14457 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BECN1Q14457 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BECN1Q14457 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BECN1Q14457 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BECN1Q14457 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BECN1Q14457 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BECN1Q14457 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BECN1Q14457 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BECN1Q14457 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BECN1Q14457 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BECN1Q14457 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BECN1Q14457 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BECN1Q14457 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BECN1Q14457 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
BECN1Q14457 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
BECN1Q14457 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
BECN1Q14457 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
BECN1Q14457 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms