Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX39BQ13838 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX39BQ13838 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX39BQ13838 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX39BQ13838 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX39BQ13838 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX39BQ13838 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX39BQ13838 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX39BQ13838 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX39BQ13838 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX39BQ13838 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX39BQ13838 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX39BQ13838 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX39BQ13838 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX39BQ13838 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX39BQ13838 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX39BQ13838 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX39BQ13838 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX39BQ13838 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX39BQ13838 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX39BQ13838 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX39BQ13838 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX39BQ13838 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX39BQ13838 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX39BQ13838 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX39BQ13838 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX39BQ13838 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX39BQ13838 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX39BQ13838 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX39BQ13838 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX39BQ13838 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX39BQ13838 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDX39BQ13838 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDX39BQ13838 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDX39BQ13838 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDX39BQ13838 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDX39BQ13838 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDX39BQ13838 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDX39BQ13838 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDX39BQ13838 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDX39BQ13838 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDX39BQ13838 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDX39BQ13838 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDX39BQ13838 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDX39BQ13838 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDX39BQ13838 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDX39BQ13838 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DDX39BQ13838 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDX39BQ13838 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DDX39BQ13838 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDX39BQ13838 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDX39BQ13838 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDX39BQ13838 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDX39BQ13838 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDX39BQ13838 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDX39BQ13838 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDX39BQ13838 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDX39BQ13838 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDX39BQ13838 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDX39BQ13838 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDX39BQ13838 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDX39BQ13838 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDX39BQ13838 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDX39BQ13838 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
DDX39BQ13838 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX39BQ13838 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX39BQ13838 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX39BQ13838 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX39BQ13838 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX39BQ13838 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX39BQ13838 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX39BQ13838 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX39BQ13838 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX39BQ13838 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DDX39BQ13838 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
DDX39BQ13838 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DDX39BQ13838 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDX39BQ13838 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDX39BQ13838 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DDX39BQ13838 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDX39BQ13838 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
DDX39BQ13838 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDX39BQ13838 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DDX39BQ13838 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX39BQ13838 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX39BQ13838 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX39BQ13838 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX39BQ13838 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX39BQ13838 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX39BQ13838 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX39BQ13838 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX39BQ13838 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX39BQ13838 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX39BQ13838 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX39BQ13838 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX39BQ13838 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX39BQ13838 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX39BQ13838 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX39BQ13838 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX39BQ13838 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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