Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HDAC1Q13547 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HDAC1Q13547 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HDAC1Q13547 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HDAC1Q13547 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
HDAC1Q13547 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HDAC1Q13547 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HDAC1Q13547 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HDAC1Q13547 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HDAC1Q13547 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HDAC1Q13547 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
HDAC1Q13547 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HDAC1Q13547 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HDAC1Q13547 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HDAC1Q13547 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HDAC1Q13547 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HDAC1Q13547 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HDAC1Q13547 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HDAC1Q13547 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HDAC1Q13547 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HDAC1Q13547 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
HDAC1Q13547 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HDAC1Q13547 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
HDAC1Q13547 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HDAC1Q13547 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
HDAC1Q13547 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HDAC1Q13547 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HDAC1Q13547 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HDAC1Q13547 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HDAC1Q13547 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HDAC1Q13547 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HDAC1Q13547 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
HDAC1Q13547 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HDAC1Q13547 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HDAC1Q13547 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HDAC1Q13547 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HDAC1Q13547 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HDAC1Q13547 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
HDAC1Q13547 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HDAC1Q13547 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HDAC1Q13547 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HDAC1Q13547 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HDAC1Q13547 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HDAC1Q13547 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HDAC1Q13547 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HDAC1Q13547 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HDAC1Q13547 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HDAC1Q13547 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HDAC1Q13547 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HDAC1Q13547 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HDAC1Q13547 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
HDAC1Q13547 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HDAC1Q13547 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HDAC1Q13547 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HDAC1Q13547 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HDAC1Q13547 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HDAC1Q13547 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HDAC1Q13547 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
HDAC1Q13547 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HDAC1Q13547 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
HDAC1Q13547 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
HDAC1Q13547 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HDAC1Q13547 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HDAC1Q13547 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HDAC1Q13547 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HDAC1Q13547 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HDAC1Q13547 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HDAC1Q13547 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HDAC1Q13547 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HDAC1Q13547 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HDAC1Q13547 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HDAC1Q13547 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HDAC1Q13547 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HDAC1Q13547 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HDAC1Q13547 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HDAC1Q13547 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HDAC1Q13547 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HDAC1Q13547 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HDAC1Q13547 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HDAC1Q13547 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HDAC1Q13547 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HDAC1Q13547 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HDAC1Q13547 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HDAC1Q13547 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HDAC1Q13547 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HDAC1Q13547 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HDAC1Q13547 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
HDAC1Q13547 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HDAC1Q13547 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HDAC1Q13547 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HDAC1Q13547 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HDAC1Q13547 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HDAC1Q13547 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HDAC1Q13547 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HDAC1Q13547 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HDAC1Q13547 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HDAC1Q13547 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HDAC1Q13547 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HDAC1Q13547 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HDAC1Q13547 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
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