Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATRQ13535 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATRQ13535 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ATRQ13535 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATRQ13535 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATRQ13535 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATRQ13535 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATRQ13535 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATRQ13535 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATRQ13535 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATRQ13535 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATRQ13535 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATRQ13535 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATRQ13535 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATRQ13535 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATRQ13535 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATRQ13535 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ATRQ13535 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATRQ13535 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATRQ13535 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATRQ13535 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATRQ13535 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATRQ13535 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATRQ13535 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATRQ13535 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ATRQ13535 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ATRQ13535 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ATRQ13535 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATRQ13535 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ATRQ13535 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATRQ13535 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATRQ13535 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATRQ13535 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATRQ13535 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATRQ13535 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATRQ13535 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATRQ13535 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATRQ13535 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATRQ13535 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATRQ13535 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATRQ13535 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATRQ13535 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATRQ13535 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATRQ13535 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ATRQ13535 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATRQ13535 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATRQ13535 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATRQ13535 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATRQ13535 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATRQ13535 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATRQ13535 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATRQ13535 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATRQ13535 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATRQ13535 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATRQ13535 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATRQ13535 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATRQ13535 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATRQ13535 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ATRQ13535 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATRQ13535 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATRQ13535 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATRQ13535 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATRQ13535 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATRQ13535 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATRQ13535 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATRQ13535 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATRQ13535 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATRQ13535 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATRQ13535 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
ATRQ13535 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
ATRQ13535 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATRQ13535 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATRQ13535 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATRQ13535 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATRQ13535 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATRQ13535 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATRQ13535 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATRQ13535 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATRQ13535 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATRQ13535 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATRQ13535 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATRQ13535 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ATRQ13535 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATRQ13535 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATRQ13535 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATRQ13535 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATRQ13535 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATRQ13535 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATRQ13535 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATRQ13535 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATRQ13535 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATRQ13535 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATRQ13535 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATRQ13535 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATRQ13535 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATRQ13535 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATRQ13535 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATRQ13535 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATRQ13535 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATRQ13535 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms