Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRPF4BQ13523 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRPF4BQ13523 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRPF4BQ13523 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRPF4BQ13523 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRPF4BQ13523 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRPF4BQ13523 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRPF4BQ13523 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRPF4BQ13523 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPF4BQ13523 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPF4BQ13523 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPF4BQ13523 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPF4BQ13523 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPF4BQ13523 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPF4BQ13523 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPF4BQ13523 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPF4BQ13523 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPF4BQ13523 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRPF4BQ13523 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRPF4BQ13523 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRPF4BQ13523 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRPF4BQ13523 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRPF4BQ13523 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PRPF4BQ13523 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRPF4BQ13523 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRPF4BQ13523 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRPF4BQ13523 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRPF4BQ13523 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRPF4BQ13523 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRPF4BQ13523 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRPF4BQ13523 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRPF4BQ13523 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRPF4BQ13523 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRPF4BQ13523 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRPF4BQ13523 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PRPF4BQ13523 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRPF4BQ13523 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPF4BQ13523 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPF4BQ13523 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPF4BQ13523 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPF4BQ13523 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPF4BQ13523 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPF4BQ13523 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPF4BQ13523 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPF4BQ13523 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPF4BQ13523 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPF4BQ13523 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPF4BQ13523 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPF4BQ13523 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPF4BQ13523 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF4BQ13523 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF4BQ13523 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF4BQ13523 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF4BQ13523 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF4BQ13523 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF4BQ13523 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF4BQ13523 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF4BQ13523 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF4BQ13523 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF4BQ13523 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRPF4BQ13523 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRPF4BQ13523 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRPF4BQ13523 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRPF4BQ13523 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRPF4BQ13523 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PRPF4BQ13523 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRPF4BQ13523 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRPF4BQ13523 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRPF4BQ13523 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRPF4BQ13523 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF4BQ13523 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF4BQ13523 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF4BQ13523 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF4BQ13523 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF4BQ13523 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF4BQ13523 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF4BQ13523 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF4BQ13523 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF4BQ13523 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF4BQ13523 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF4BQ13523 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF4BQ13523 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF4BQ13523 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF4BQ13523 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF4BQ13523 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF4BQ13523 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF4BQ13523 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF4BQ13523 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF4BQ13523 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF4BQ13523 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF4BQ13523 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPF4BQ13523 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPF4BQ13523 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPF4BQ13523 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPF4BQ13523 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPF4BQ13523 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPF4BQ13523 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF4BQ13523 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF4BQ13523 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF4BQ13523 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
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