Protein–RNA interactions for Protein: Q13496

MTM1, Myotubularin, humanhuman

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Length 603 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTM1Q13496 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTM1Q13496 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTM1Q13496 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTM1Q13496 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTM1Q13496 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTM1Q13496 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTM1Q13496 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MTM1Q13496 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTM1Q13496 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTM1Q13496 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTM1Q13496 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTM1Q13496 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTM1Q13496 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTM1Q13496 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTM1Q13496 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTM1Q13496 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTM1Q13496 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTM1Q13496 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTM1Q13496 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTM1Q13496 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTM1Q13496 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTM1Q13496 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTM1Q13496 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTM1Q13496 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTM1Q13496 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTM1Q13496 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTM1Q13496 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTM1Q13496 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTM1Q13496 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTM1Q13496 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTM1Q13496 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTM1Q13496 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTM1Q13496 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MTM1Q13496 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTM1Q13496 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTM1Q13496 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTM1Q13496 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTM1Q13496 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTM1Q13496 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTM1Q13496 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTM1Q13496 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTM1Q13496 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTM1Q13496 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTM1Q13496 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTM1Q13496 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTM1Q13496 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTM1Q13496 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTM1Q13496 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTM1Q13496 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTM1Q13496 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTM1Q13496 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTM1Q13496 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTM1Q13496 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTM1Q13496 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTM1Q13496 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTM1Q13496 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTM1Q13496 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTM1Q13496 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTM1Q13496 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTM1Q13496 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTM1Q13496 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTM1Q13496 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTM1Q13496 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTM1Q13496 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTM1Q13496 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MTM1Q13496 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTM1Q13496 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTM1Q13496 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTM1Q13496 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTM1Q13496 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTM1Q13496 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTM1Q13496 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTM1Q13496 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTM1Q13496 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTM1Q13496 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTM1Q13496 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTM1Q13496 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTM1Q13496 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTM1Q13496 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTM1Q13496 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTM1Q13496 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTM1Q13496 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTM1Q13496 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTM1Q13496 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTM1Q13496 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MTM1Q13496 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MTM1Q13496 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTM1Q13496 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTM1Q13496 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MTM1Q13496 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MTM1Q13496 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTM1Q13496 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTM1Q13496 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTM1Q13496 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTM1Q13496 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTM1Q13496 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTM1Q13496 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTM1Q13496 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTM1Q13496 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTM1Q13496 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
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