Protein–RNA interactions for Protein: Q13439

GOLGA4, Golgin subfamily A member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA4Q13439 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA4Q13439 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA4Q13439 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA4Q13439 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA4Q13439 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA4Q13439 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA4Q13439 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA4Q13439 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA4Q13439 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA4Q13439 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA4Q13439 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA4Q13439 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA4Q13439 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA4Q13439 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA4Q13439 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA4Q13439 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA4Q13439 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA4Q13439 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA4Q13439 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA4Q13439 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA4Q13439 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA4Q13439 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA4Q13439 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA4Q13439 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA4Q13439 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA4Q13439 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA4Q13439 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA4Q13439 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA4Q13439 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA4Q13439 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA4Q13439 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA4Q13439 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA4Q13439 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA4Q13439 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA4Q13439 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA4Q13439 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA4Q13439 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA4Q13439 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA4Q13439 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA4Q13439 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA4Q13439 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA4Q13439 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA4Q13439 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA4Q13439 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA4Q13439 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA4Q13439 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA4Q13439 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA4Q13439 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA4Q13439 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA4Q13439 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA4Q13439 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA4Q13439 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA4Q13439 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA4Q13439 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA4Q13439 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA4Q13439 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA4Q13439 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA4Q13439 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA4Q13439 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA4Q13439 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA4Q13439 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA4Q13439 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA4Q13439 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA4Q13439 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA4Q13439 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA4Q13439 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA4Q13439 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA4Q13439 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA4Q13439 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA4Q13439 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA4Q13439 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA4Q13439 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA4Q13439 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA4Q13439 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA4Q13439 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA4Q13439 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA4Q13439 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA4Q13439 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA4Q13439 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA4Q13439 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA4Q13439 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA4Q13439 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA4Q13439 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA4Q13439 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLGA4Q13439 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLGA4Q13439 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLGA4Q13439 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLGA4Q13439 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLGA4Q13439 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLGA4Q13439 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GOLGA4Q13439 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GOLGA4Q13439 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOLGA4Q13439 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOLGA4Q13439 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GOLGA4Q13439 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOLGA4Q13439 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOLGA4Q13439 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOLGA4Q13439 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GOLGA4Q13439 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOLGA4Q13439 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms