Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPA4Q13156 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPA4Q13156 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPA4Q13156 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPA4Q13156 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPA4Q13156 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPA4Q13156 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPA4Q13156 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RPA4Q13156 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RPA4Q13156 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RPA4Q13156 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RPA4Q13156 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPA4Q13156 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPA4Q13156 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPA4Q13156 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPA4Q13156 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPA4Q13156 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPA4Q13156 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPA4Q13156 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPA4Q13156 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPA4Q13156 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPA4Q13156 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPA4Q13156 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RPA4Q13156 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPA4Q13156 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPA4Q13156 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPA4Q13156 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RPA4Q13156 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPA4Q13156 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPA4Q13156 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPA4Q13156 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPA4Q13156 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPA4Q13156 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPA4Q13156 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPA4Q13156 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPA4Q13156 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPA4Q13156 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPA4Q13156 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPA4Q13156 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPA4Q13156 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RPA4Q13156 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPA4Q13156 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPA4Q13156 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPA4Q13156 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPA4Q13156 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPA4Q13156 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPA4Q13156 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPA4Q13156 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPA4Q13156 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPA4Q13156 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPA4Q13156 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPA4Q13156 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPA4Q13156 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPA4Q13156 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPA4Q13156 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPA4Q13156 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPA4Q13156 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPA4Q13156 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPA4Q13156 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPA4Q13156 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPA4Q13156 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPA4Q13156 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPA4Q13156 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPA4Q13156 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPA4Q13156 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPA4Q13156 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPA4Q13156 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPA4Q13156 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPA4Q13156 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPA4Q13156 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPA4Q13156 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPA4Q13156 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPA4Q13156 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPA4Q13156 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPA4Q13156 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPA4Q13156 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPA4Q13156 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPA4Q13156 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPA4Q13156 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPA4Q13156 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPA4Q13156 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPA4Q13156 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPA4Q13156 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPA4Q13156 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPA4Q13156 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPA4Q13156 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RPA4Q13156 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPA4Q13156 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPA4Q13156 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPA4Q13156 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPA4Q13156 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPA4Q13156 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPA4Q13156 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPA4Q13156 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPA4Q13156 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPA4Q13156 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPA4Q13156 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPA4Q13156 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPA4Q13156 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPA4Q13156 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
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