Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF3Q13114 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF3Q13114 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF3Q13114 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF3Q13114 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF3Q13114 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF3Q13114 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF3Q13114 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF3Q13114 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF3Q13114 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF3Q13114 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF3Q13114 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF3Q13114 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF3Q13114 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF3Q13114 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF3Q13114 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF3Q13114 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF3Q13114 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF3Q13114 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF3Q13114 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF3Q13114 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
TRAF3Q13114 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAF3Q13114 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF3Q13114 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF3Q13114 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF3Q13114 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF3Q13114 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF3Q13114 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF3Q13114 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF3Q13114 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF3Q13114 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF3Q13114 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF3Q13114 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF3Q13114 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF3Q13114 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF3Q13114 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF3Q13114 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF3Q13114 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF3Q13114 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
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