Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BNIP3Q12983 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BNIP3Q12983 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BNIP3Q12983 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BNIP3Q12983 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BNIP3Q12983 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BNIP3Q12983 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BNIP3Q12983 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BNIP3Q12983 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BNIP3Q12983 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BNIP3Q12983 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BNIP3Q12983 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BNIP3Q12983 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BNIP3Q12983 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BNIP3Q12983 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BNIP3Q12983 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BNIP3Q12983 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BNIP3Q12983 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BNIP3Q12983 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BNIP3Q12983 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BNIP3Q12983 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BNIP3Q12983 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BNIP3Q12983 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BNIP3Q12983 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BNIP3Q12983 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BNIP3Q12983 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BNIP3Q12983 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BNIP3Q12983 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BNIP3Q12983 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BNIP3Q12983 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BNIP3Q12983 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BNIP3Q12983 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BNIP3Q12983 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BNIP3Q12983 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BNIP3Q12983 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BNIP3Q12983 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BNIP3Q12983 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BNIP3Q12983 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BNIP3Q12983 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BNIP3Q12983 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BNIP3Q12983 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BNIP3Q12983 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BNIP3Q12983 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BNIP3Q12983 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BNIP3Q12983 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BNIP3Q12983 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BNIP3Q12983 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BNIP3Q12983 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BNIP3Q12983 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BNIP3Q12983 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BNIP3Q12983 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BNIP3Q12983 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BNIP3Q12983 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BNIP3Q12983 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BNIP3Q12983 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BNIP3Q12983 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BNIP3Q12983 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BNIP3Q12983 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BNIP3Q12983 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BNIP3Q12983 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BNIP3Q12983 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BNIP3Q12983 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BNIP3Q12983 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BNIP3Q12983 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BNIP3Q12983 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BNIP3Q12983 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BNIP3Q12983 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BNIP3Q12983 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BNIP3Q12983 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BNIP3Q12983 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BNIP3Q12983 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BNIP3Q12983 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BNIP3Q12983 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BNIP3Q12983 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BNIP3Q12983 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BNIP3Q12983 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BNIP3Q12983 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
BNIP3Q12983 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BNIP3Q12983 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BNIP3Q12983 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BNIP3Q12983 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BNIP3Q12983 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BNIP3Q12983 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BNIP3Q12983 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BNIP3Q12983 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BNIP3Q12983 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BNIP3Q12983 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BNIP3Q12983 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BNIP3Q12983 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BNIP3Q12983 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BNIP3Q12983 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BNIP3Q12983 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BNIP3Q12983 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BNIP3Q12983 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BNIP3Q12983 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BNIP3Q12983 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
BNIP3Q12983 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BNIP3Q12983 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BNIP3Q12983 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BNIP3Q12983 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms