Protein–RNA interactions for Protein: Q12173

TY3A-G, Transposon Ty3-G Gag polyprotein, yeast

Predictions only

Length 290 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TY3A-G	Q12173	ADK2	YER170W	678 nt		5.28	□□□□□ -1.56
TY3A-G	Q12173	TYS1	YGR185C	1185 nt		5.28	□□□□□ -1.56
TY3A-G	Q12173	MRPL15	YLR312W-A	762 nt		5.28	□□□□□ -1.56
TY3A-G	Q12173	PRR1	YKL116C	1557 nt		5.28	□□□□□ -1.56
TY3A-G	Q12173	TUP1	YCR084C	2142 nt		5.27	□□□□□ -1.57
TY3A-G	Q12173	SSZ1	YHR064C	1617 nt		5.27	□□□□□ -1.57
TY3A-G	Q12173	DPH6	YLR143W	2058 nt		5.27	□□□□□ -1.57
TY3A-G	Q12173	YGP1	YNL160W	1065 nt		5.27	□□□□□ -1.57
TY3A-G	Q12173	ECM23	YPL021W	564 nt		5.27	□□□□□ -1.57
TY3A-G	Q12173	SPN1	YPR133C	1233 nt		5.27	□□□□□ -1.57
TY3A-G	Q12173	CEG1	YGL130W	1380 nt		5.27	□□□□□ -1.57
TY3A-G	Q12173	GIP1	YBR045C	1920 nt		5.27	□□□□□ -1.57
TY3A-G	Q12173	FUM1	YPL262W	1467 nt		5.26	□□□□□ -1.57
TY3A-G	Q12173	GRS1	YBR121C	2004 nt		5.26	□□□□□ -1.57
TY3A-G	Q12173	SNF3	YDL194W	2655 nt		5.26	□□□□□ -1.57
TY3A-G	Q12173	FRT2	YAL028W	1587 nt		5.26	□□□□□ -1.57
TY3A-G	Q12173	THI5	YFL058W	1023 nt		5.26	□□□□□ -1.57
TY3A-G	Q12173	THI12	YNL332W	1023 nt		5.26	□□□□□ -1.57
TY3A-G	Q12173	ATG14	YBR128C	1035 nt		5.26	□□□□□ -1.57
TY3A-G	Q12173	snR32	snR32	188 nt		5.26	□□□□□ -1.57
TY3A-G	Q12173	DUR1,2	YBR208C	5508 nt		5.26	□□□□□ -1.57
TY3A-G	Q12173	MMT2	YPL224C	1455 nt		5.26	□□□□□ -1.57
TY3A-G	Q12173	SSH4	YKL124W	1740 nt		5.26	□□□□□ -1.57
TY3A-G	Q12173	ASA1	YPR085C	1332 nt		5.25	□□□□□ -1.57
TY3A-G	Q12173	FAP1	YNL023C	2898 nt		5.25	□□□□□ -1.57
TY3A-G	Q12173	TYW3	YGL050W	822 nt		5.25	□□□□□ -1.57
TY3A-G	Q12173	NQM1	YGR043C	1002 nt		5.25	□□□□□ -1.57
TY3A-G	Q12173	SSY5	YJL156C	2100 nt		5.25	□□□□□ -1.57
TY3A-G	Q12173	YKR041W	YKR041W	753 nt		5.25	□□□□□ -1.57
TY3A-G	Q12173	RRN9	YMR270C	1098 nt		5.25	□□□□□ -1.57
TY3A-G	Q12173	HIR2	YOR038C	2628 nt		5.25	□□□□□ -1.57
TY3A-G	Q12173	NGR1	YBR212W	2019 nt		5.24	□□□□□ -1.57
TY3A-G	Q12173	FRE3	YOR381W	2136 nt		5.24	□□□□□ -1.57
TY3A-G	Q12173	MEC3	YLR288C	1425 nt		5.24	□□□□□ -1.57
TY3A-G	Q12173	STB3	YDR169C	1542 nt		5.24	□□□□□ -1.57
TY3A-G	Q12173	ATG18	YFR021W	1503 nt		5.24	□□□□□ -1.57
TY3A-G	Q12173	CNM67	YNL225C	1746 nt		5.24	□□□□□ -1.57
TY3A-G	Q12173	RXT3	YDL076C	885 nt		5.24	□□□□□ -1.57
TY3A-G	Q12173	CIA2	YHR122W	696 nt		5.24	□□□□□ -1.57
TY3A-G	Q12173	SOL1	YNR034W	966 nt		5.24	□□□□□ -1.57
TY3A-G	Q12173	APL6	YGR261C	2430 nt		5.24	□□□□□ -1.57
TY3A-G	Q12173	YNL095C	YNL095C	1929 nt		5.23	□□□□□ -1.57
TY3A-G	Q12173	PHO86	YJL117W	936 nt		5.23	□□□□□ -1.57
TY3A-G	Q12173	MRPL20	YKR085C	588 nt		5.23	□□□□□ -1.57
TY3A-G	Q12173	MRI1	YPR118W	1236 nt		5.23	□□□□□ -1.57
TY3A-G	Q12173	SIP5	YMR140W	1470 nt		5.23	□□□□□ -1.57
TY3A-G	Q12173	RRN3	YKL125W	1884 nt		5.23	□□□□□ -1.57
TY3A-G	Q12173	TIP41	YPR040W	1071 nt		5.22	□□□□□ -1.57
TY3A-G	Q12173	PRT1	YOR361C	2292 nt		5.22	□□□□□ -1.57
TY3A-G	Q12173	NOP58	YOR310C	1536 nt		5.22	□□□□□ -1.57
TY3A-G	Q12173	YHR193C-A	YHR193C-A	375 nt		5.21	□□□□□ -1.58
TY3A-G	Q12173	RFU1	YLR073C	603 nt		5.21	□□□□□ -1.58
TY3A-G	Q12173	MDG1	YNL173C	1101 nt		5.21	□□□□□ -1.58
TY3A-G	Q12173	ECM2	YBR065C	1095 nt		5.21	□□□□□ -1.58
TY3A-G	Q12173	snR19	snR19	568 nt		5.21	□□□□□ -1.58
TY3A-G	Q12173	ATG1	YGL180W	2694 nt		5.21	□□□□□ -1.58
TY3A-G	Q12173	ADE3	YGR204W	2841 nt		5.21	□□□□□ -1.58
TY3A-G	Q12173	PSE1	YMR308C	3270 nt		5.21	□□□□□ -1.58
TY3A-G	Q12173	RAD57	YDR004W	1383 nt		5.2	□□□□□ -1.58
TY3A-G	Q12173	DBF4	YDR052C	2115 nt		5.2	□□□□□ -1.58
TY3A-G	Q12173	VHS1	YDR247W	1386 nt		5.2	□□□□□ -1.58
TY3A-G	Q12173	GCR2	YNL199C	1605 nt		5.2	□□□□□ -1.58
TY3A-G	Q12173	SRG1	SRG1	551 nt		5.2	□□□□□ -1.58
TY3A-G	Q12173	YAR019W-A	YAR019W-A	333 nt		5.2	□□□□□ -1.58
TY3A-G	Q12173	YNG1	YOR064C	660 nt		5.2	□□□□□ -1.58
TY3A-G	Q12173	YPR169W-A	YPR169W-A	219 nt		5.2	□□□□□ -1.58
TY3A-G	Q12173	YPR170W-B	YPR170W-B	258 nt		5.2	□□□□□ -1.58
TY3A-G	Q12173	SUM1	YDR310C	3189 nt		5.2	□□□□□ -1.58
TY3A-G	Q12173	CLA4	YNL298W	2529 nt		5.2	□□□□□ -1.58
TY3A-G	Q12173	RRP3	YHR065C	1506 nt		5.19	□□□□□ -1.58
TY3A-G	Q12173	YDL121C	YDL121C	450 nt		5.19	□□□□□ -1.58
TY3A-G	Q12173	CIN5	YOR028C	888 nt		5.19	□□□□□ -1.58
TY3A-G	Q12173	ISU2	YOR226C	471 nt		5.19	□□□□□ -1.58
TY3A-G	Q12173	COX11	YPL132W	903 nt		5.19	□□□□□ -1.58
TY3A-G	Q12173	YPL278C	YPL278C	303 nt		5.19	□□□□□ -1.58
TY3A-G	Q12173	RAT1	YOR048C	3021 nt		5.19	□□□□□ -1.58
TY3A-G	Q12173	ASK10	YGR097W	3441 nt		5.18	□□□□□ -1.58
TY3A-G	Q12173	WTM2	YOR229W	1404 nt		5.18	□□□□□ -1.58
TY3A-G	Q12173	ARF2	YDL137W	546 nt		5.18	□□□□□ -1.58
TY3A-G	Q12173	AIR2	YDL175C	1035 nt		5.18	□□□□□ -1.58
TY3A-G	Q12173	SKI6	YGR195W	741 nt		5.18	□□□□□ -1.58
TY3A-G	Q12173	YLR157W-D	YLR157W-D	213 nt		5.18	□□□□□ -1.58
TY3A-G	Q12173	ETT1	YOR051C	1239 nt		5.18	□□□□□ -1.58
TY3A-G	Q12173	FOX2	YKR009C	2703 nt		5.18	□□□□□ -1.58
TY3A-G	Q12173	MBP1	YDL056W	2502 nt		5.18	□□□□□ -1.58
TY3A-G	Q12173	MTW1	YAL034W-A	870 nt		5.17	□□□□□ -1.58
TY3A-G	Q12173	NMA1	YLR328W	1206 nt		5.17	□□□□□ -1.58
TY3A-G	Q12173	SAP30	YMR263W	606 nt		5.17	□□□□□ -1.58
TY3A-G	Q12173	DSC2	YOL073C	969 nt		5.17	□□□□□ -1.58
TY3A-G	Q12173	UMP1	YBR173C	447 nt		5.17	□□□□□ -1.58
TY3A-G	Q12173	RIM15	YFL033C	5313 nt		5.17	□□□□□ -1.58
TY3A-G	Q12173	SEC39	YLR440C	2130 nt		5.17	□□□□□ -1.58
TY3A-G	Q12173	MCM4	YPR019W	2802 nt		5.16	□□□□□ -1.58
TY3A-G	Q12173	OCA5	YHL029C	2040 nt		5.16	□□□□□ -1.58
TY3A-G	Q12173	AZR1	YGR224W	1842 nt		5.16	□□□□□ -1.58
TY3A-G	Q12173	PUS1	YPL212C	1635 nt		5.16	□□□□□ -1.58
TY3A-G	Q12173	BIT2	YBR270C	1638 nt		5.16	□□□□□ -1.58
TY3A-G	Q12173	ASP1	YDR321W	1146 nt		5.16	□□□□□ -1.58
TY3A-G	Q12173	PCL1	YNL289W	840 nt		5.16	□□□□□ -1.58
TY3A-G	Q12173	SLD7	YOR060C	774 nt		5.16	□□□□□ -1.58

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