Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH1

ACSM1, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM1Q08AH1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACSM1Q08AH1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACSM1Q08AH1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACSM1Q08AH1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACSM1Q08AH1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACSM1Q08AH1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACSM1Q08AH1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
ACSM1Q08AH1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACSM1Q08AH1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACSM1Q08AH1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACSM1Q08AH1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACSM1Q08AH1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACSM1Q08AH1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACSM1Q08AH1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACSM1Q08AH1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACSM1Q08AH1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACSM1Q08AH1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACSM1Q08AH1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACSM1Q08AH1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACSM1Q08AH1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACSM1Q08AH1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACSM1Q08AH1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ACSM1Q08AH1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACSM1Q08AH1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACSM1Q08AH1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ACSM1Q08AH1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACSM1Q08AH1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACSM1Q08AH1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACSM1Q08AH1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACSM1Q08AH1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACSM1Q08AH1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACSM1Q08AH1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACSM1Q08AH1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ACSM1Q08AH1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ACSM1Q08AH1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACSM1Q08AH1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACSM1Q08AH1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACSM1Q08AH1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACSM1Q08AH1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACSM1Q08AH1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACSM1Q08AH1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACSM1Q08AH1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ACSM1Q08AH1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACSM1Q08AH1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ACSM1Q08AH1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACSM1Q08AH1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACSM1Q08AH1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACSM1Q08AH1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACSM1Q08AH1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACSM1Q08AH1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACSM1Q08AH1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACSM1Q08AH1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACSM1Q08AH1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACSM1Q08AH1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACSM1Q08AH1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACSM1Q08AH1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACSM1Q08AH1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACSM1Q08AH1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACSM1Q08AH1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACSM1Q08AH1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACSM1Q08AH1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACSM1Q08AH1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACSM1Q08AH1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACSM1Q08AH1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACSM1Q08AH1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACSM1Q08AH1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACSM1Q08AH1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACSM1Q08AH1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACSM1Q08AH1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACSM1Q08AH1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACSM1Q08AH1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACSM1Q08AH1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACSM1Q08AH1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACSM1Q08AH1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACSM1Q08AH1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACSM1Q08AH1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACSM1Q08AH1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACSM1Q08AH1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACSM1Q08AH1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ACSM1Q08AH1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ACSM1Q08AH1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ACSM1Q08AH1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACSM1Q08AH1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACSM1Q08AH1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACSM1Q08AH1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACSM1Q08AH1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACSM1Q08AH1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACSM1Q08AH1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACSM1Q08AH1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACSM1Q08AH1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ACSM1Q08AH1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACSM1Q08AH1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACSM1Q08AH1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACSM1Q08AH1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACSM1Q08AH1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACSM1Q08AH1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACSM1Q08AH1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACSM1Q08AH1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACSM1Q08AH1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ACSM1Q08AH1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms