Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP3CAQ08209 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP3CAQ08209 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP3CAQ08209 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP3CAQ08209 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP3CAQ08209 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP3CAQ08209 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP3CAQ08209 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP3CAQ08209 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP3CAQ08209 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP3CAQ08209 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP3CAQ08209 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP3CAQ08209 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP3CAQ08209 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP3CAQ08209 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP3CAQ08209 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP3CAQ08209 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP3CAQ08209 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP3CAQ08209 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP3CAQ08209 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP3CAQ08209 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP3CAQ08209 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP3CAQ08209 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPP3CAQ08209 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPP3CAQ08209 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPP3CAQ08209 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPP3CAQ08209 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPP3CAQ08209 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPP3CAQ08209 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPP3CAQ08209 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPP3CAQ08209 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPP3CAQ08209 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPP3CAQ08209 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPP3CAQ08209 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPP3CAQ08209 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPP3CAQ08209 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPP3CAQ08209 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPP3CAQ08209 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPP3CAQ08209 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PPP3CAQ08209 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPP3CAQ08209 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP3CAQ08209 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP3CAQ08209 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP3CAQ08209 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP3CAQ08209 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP3CAQ08209 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP3CAQ08209 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP3CAQ08209 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP3CAQ08209 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP3CAQ08209 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP3CAQ08209 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP3CAQ08209 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP3CAQ08209 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP3CAQ08209 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP3CAQ08209 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP3CAQ08209 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP3CAQ08209 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP3CAQ08209 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP3CAQ08209 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP3CAQ08209 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP3CAQ08209 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP3CAQ08209 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP3CAQ08209 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP3CAQ08209 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP3CAQ08209 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP3CAQ08209 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP3CAQ08209 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP3CAQ08209 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP3CAQ08209 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP3CAQ08209 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP3CAQ08209 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP3CAQ08209 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP3CAQ08209 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP3CAQ08209 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP3CAQ08209 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP3CAQ08209 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP3CAQ08209 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP3CAQ08209 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP3CAQ08209 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP3CAQ08209 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP3CAQ08209 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP3CAQ08209 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP3CAQ08209 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP3CAQ08209 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP3CAQ08209 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP3CAQ08209 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP3CAQ08209 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP3CAQ08209 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP3CAQ08209 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP3CAQ08209 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP3CAQ08209 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP3CAQ08209 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP3CAQ08209 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP3CAQ08209 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP3CAQ08209 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP3CAQ08209 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP3CAQ08209 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP3CAQ08209 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP3CAQ08209 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP3CAQ08209 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms