Protein–RNA interactions for Protein: Q08043

ACTN3, Alpha-actinin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3Q08043 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTN3Q08043 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTN3Q08043 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTN3Q08043 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTN3Q08043 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTN3Q08043 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTN3Q08043 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTN3Q08043 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTN3Q08043 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTN3Q08043 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTN3Q08043 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTN3Q08043 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTN3Q08043 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTN3Q08043 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTN3Q08043 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTN3Q08043 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTN3Q08043 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTN3Q08043 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTN3Q08043 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTN3Q08043 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTN3Q08043 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ACTN3Q08043 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ACTN3Q08043 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ACTN3Q08043 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACTN3Q08043 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACTN3Q08043 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
ACTN3Q08043 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ACTN3Q08043 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACTN3Q08043 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACTN3Q08043 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACTN3Q08043 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
ACTN3Q08043 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACTN3Q08043 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ACTN3Q08043 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACTN3Q08043 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACTN3Q08043 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTN3Q08043 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTN3Q08043 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTN3Q08043 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTN3Q08043 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTN3Q08043 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTN3Q08043 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTN3Q08043 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTN3Q08043 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTN3Q08043 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTN3Q08043 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTN3Q08043 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTN3Q08043 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTN3Q08043 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTN3Q08043 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTN3Q08043 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTN3Q08043 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTN3Q08043 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTN3Q08043 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTN3Q08043 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTN3Q08043 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTN3Q08043 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTN3Q08043 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTN3Q08043 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTN3Q08043 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTN3Q08043 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTN3Q08043 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTN3Q08043 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTN3Q08043 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTN3Q08043 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTN3Q08043 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTN3Q08043 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTN3Q08043 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTN3Q08043 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTN3Q08043 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTN3Q08043 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTN3Q08043 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTN3Q08043 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTN3Q08043 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTN3Q08043 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTN3Q08043 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTN3Q08043 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTN3Q08043 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.95■■□□□ 1.27
ACTN3Q08043 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTN3Q08043 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTN3Q08043 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTN3Q08043 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTN3Q08043 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTN3Q08043 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTN3Q08043 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTN3Q08043 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTN3Q08043 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTN3Q08043 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTN3Q08043 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTN3Q08043 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTN3Q08043 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTN3Q08043 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTN3Q08043 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTN3Q08043 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTN3Q08043 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTN3Q08043 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTN3Q08043 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTN3Q08043 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTN3Q08043 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTN3Q08043 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms