Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLEQ07864 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLEQ07864 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLEQ07864 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLEQ07864 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLEQ07864 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLEQ07864 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLEQ07864 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLEQ07864 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLEQ07864 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLEQ07864 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
POLEQ07864 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLEQ07864 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLEQ07864 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLEQ07864 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
POLEQ07864 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLEQ07864 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLEQ07864 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLEQ07864 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLEQ07864 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLEQ07864 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLEQ07864 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLEQ07864 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLEQ07864 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLEQ07864 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLEQ07864 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
POLEQ07864 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLEQ07864 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
POLEQ07864 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
POLEQ07864 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
POLEQ07864 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
POLEQ07864 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
POLEQ07864 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
POLEQ07864 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLEQ07864 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLEQ07864 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLEQ07864 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLEQ07864 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLEQ07864 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLEQ07864 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLEQ07864 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLEQ07864 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLEQ07864 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLEQ07864 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLEQ07864 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLEQ07864 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLEQ07864 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLEQ07864 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLEQ07864 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLEQ07864 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLEQ07864 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLEQ07864 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLEQ07864 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLEQ07864 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLEQ07864 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLEQ07864 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLEQ07864 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLEQ07864 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLEQ07864 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLEQ07864 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLEQ07864 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLEQ07864 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
POLEQ07864 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLEQ07864 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLEQ07864 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLEQ07864 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLEQ07864 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLEQ07864 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLEQ07864 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLEQ07864 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLEQ07864 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLEQ07864 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLEQ07864 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLEQ07864 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLEQ07864 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLEQ07864 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLEQ07864 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLEQ07864 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLEQ07864 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLEQ07864 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLEQ07864 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLEQ07864 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLEQ07864 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
POLEQ07864 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLEQ07864 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
POLEQ07864 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLEQ07864 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLEQ07864 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLEQ07864 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLEQ07864 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLEQ07864 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLEQ07864 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLEQ07864 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLEQ07864 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
POLEQ07864 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
POLEQ07864 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
POLEQ07864 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
POLEQ07864 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLEQ07864 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLEQ07864 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms