Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
LTBQ06643 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LTBQ06643 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LTBQ06643 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LTBQ06643 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LTBQ06643 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LTBQ06643 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LTBQ06643 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LTBQ06643 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LTBQ06643 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LTBQ06643 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LTBQ06643 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LTBQ06643 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LTBQ06643 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LTBQ06643 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LTBQ06643 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LTBQ06643 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LTBQ06643 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LTBQ06643 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LTBQ06643 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LTBQ06643 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LTBQ06643 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LTBQ06643 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LTBQ06643 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LTBQ06643 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LTBQ06643 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
LTBQ06643 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LTBQ06643 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
LTBQ06643 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
LTBQ06643 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
LTBQ06643 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
LTBQ06643 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
LTBQ06643 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LTBQ06643 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LTBQ06643 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LTBQ06643 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LTBQ06643 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LTBQ06643 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
LTBQ06643 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LTBQ06643 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LTBQ06643 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LTBQ06643 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LTBQ06643 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LTBQ06643 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LTBQ06643 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LTBQ06643 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LTBQ06643 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LTBQ06643 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LTBQ06643 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LTBQ06643 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LTBQ06643 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LTBQ06643 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LTBQ06643 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LTBQ06643 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LTBQ06643 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LTBQ06643 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LTBQ06643 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LTBQ06643 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LTBQ06643 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LTBQ06643 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LTBQ06643 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LTBQ06643 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
LTBQ06643 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LTBQ06643 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LTBQ06643 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LTBQ06643 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LTBQ06643 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LTBQ06643 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LTBQ06643 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LTBQ06643 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LTBQ06643 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LTBQ06643 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LTBQ06643 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LTBQ06643 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LTBQ06643 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LTBQ06643 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LTBQ06643 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LTBQ06643 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LTBQ06643 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LTBQ06643 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LTBQ06643 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LTBQ06643 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LTBQ06643 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LTBQ06643 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LTBQ06643 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LTBQ06643 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LTBQ06643 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LTBQ06643 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LTBQ06643 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
LTBQ06643 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LTBQ06643 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LTBQ06643 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
LTBQ06643 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LTBQ06643 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LTBQ06643 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LTBQ06643 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LTBQ06643 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LTBQ06643 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LTBQ06643 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LTBQ06643 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms