Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAD51Q06609 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAD51Q06609 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAD51Q06609 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD51Q06609 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD51Q06609 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD51Q06609 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD51Q06609 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD51Q06609 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD51Q06609 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD51Q06609 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD51Q06609 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD51Q06609 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD51Q06609 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD51Q06609 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD51Q06609 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD51Q06609 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD51Q06609 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD51Q06609 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD51Q06609 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD51Q06609 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD51Q06609 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD51Q06609 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD51Q06609 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD51Q06609 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD51Q06609 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD51Q06609 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD51Q06609 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD51Q06609 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD51Q06609 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD51Q06609 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD51Q06609 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD51Q06609 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD51Q06609 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD51Q06609 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD51Q06609 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD51Q06609 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD51Q06609 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD51Q06609 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD51Q06609 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD51Q06609 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD51Q06609 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAD51Q06609 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAD51Q06609 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAD51Q06609 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAD51Q06609 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAD51Q06609 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAD51Q06609 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAD51Q06609 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAD51Q06609 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAD51Q06609 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAD51Q06609 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAD51Q06609 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAD51Q06609 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAD51Q06609 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD51Q06609 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD51Q06609 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD51Q06609 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD51Q06609 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD51Q06609 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD51Q06609 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD51Q06609 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD51Q06609 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD51Q06609 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD51Q06609 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD51Q06609 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD51Q06609 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD51Q06609 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD51Q06609 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD51Q06609 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD51Q06609 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD51Q06609 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD51Q06609 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD51Q06609 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD51Q06609 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD51Q06609 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD51Q06609 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD51Q06609 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD51Q06609 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD51Q06609 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD51Q06609 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD51Q06609 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD51Q06609 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD51Q06609 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD51Q06609 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD51Q06609 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD51Q06609 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD51Q06609 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD51Q06609 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD51Q06609 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD51Q06609 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD51Q06609 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD51Q06609 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD51Q06609 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD51Q06609 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAD51Q06609 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAD51Q06609 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAD51Q06609 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAD51Q06609 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAD51Q06609 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms