Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CALD1Q05682 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CALD1Q05682 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CALD1Q05682 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CALD1Q05682 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CALD1Q05682 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CALD1Q05682 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CALD1Q05682 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CALD1Q05682 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CALD1Q05682 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CALD1Q05682 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CALD1Q05682 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CALD1Q05682 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CALD1Q05682 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CALD1Q05682 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CALD1Q05682 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CALD1Q05682 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CALD1Q05682 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CALD1Q05682 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CALD1Q05682 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CALD1Q05682 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CALD1Q05682 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
CALD1Q05682 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CALD1Q05682 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CALD1Q05682 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CALD1Q05682 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CALD1Q05682 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CALD1Q05682 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CALD1Q05682 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CALD1Q05682 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CALD1Q05682 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CALD1Q05682 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CALD1Q05682 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CALD1Q05682 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CALD1Q05682 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CALD1Q05682 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CALD1Q05682 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CALD1Q05682 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CALD1Q05682 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CALD1Q05682 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CALD1Q05682 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CALD1Q05682 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CALD1Q05682 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CALD1Q05682 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CALD1Q05682 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CALD1Q05682 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CALD1Q05682 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CALD1Q05682 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CALD1Q05682 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CALD1Q05682 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CALD1Q05682 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CALD1Q05682 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CALD1Q05682 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CALD1Q05682 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CALD1Q05682 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CALD1Q05682 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CALD1Q05682 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CALD1Q05682 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CALD1Q05682 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CALD1Q05682 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CALD1Q05682 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CALD1Q05682 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CALD1Q05682 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CALD1Q05682 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CALD1Q05682 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CALD1Q05682 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CALD1Q05682 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CALD1Q05682 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
CALD1Q05682 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
CALD1Q05682 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CALD1Q05682 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CALD1Q05682 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
CALD1Q05682 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CALD1Q05682 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CALD1Q05682 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CALD1Q05682 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CALD1Q05682 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
CALD1Q05682 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
CALD1Q05682 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CALD1Q05682 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CALD1Q05682 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CALD1Q05682 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CALD1Q05682 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CALD1Q05682 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CALD1Q05682 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CALD1Q05682 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CALD1Q05682 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CALD1Q05682 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CALD1Q05682 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CALD1Q05682 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CALD1Q05682 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CALD1Q05682 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
CALD1Q05682 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CALD1Q05682 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CALD1Q05682 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CALD1Q05682 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CALD1Q05682 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CALD1Q05682 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
CALD1Q05682 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CALD1Q05682 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms