Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
GRIN1Q05586 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GRIN1Q05586 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GRIN1Q05586 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GRIN1Q05586 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GRIN1Q05586 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GRIN1Q05586 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRIN1Q05586 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRIN1Q05586 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRIN1Q05586 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRIN1Q05586 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRIN1Q05586 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRIN1Q05586 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRIN1Q05586 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRIN1Q05586 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRIN1Q05586 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRIN1Q05586 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRIN1Q05586 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRIN1Q05586 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRIN1Q05586 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIN1Q05586 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIN1Q05586 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIN1Q05586 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIN1Q05586 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIN1Q05586 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIN1Q05586 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIN1Q05586 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIN1Q05586 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIN1Q05586 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIN1Q05586 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIN1Q05586 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIN1Q05586 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIN1Q05586 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIN1Q05586 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRIN1Q05586 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRIN1Q05586 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRIN1Q05586 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRIN1Q05586 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRIN1Q05586 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRIN1Q05586 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRIN1Q05586 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIN1Q05586 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIN1Q05586 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIN1Q05586 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIN1Q05586 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIN1Q05586 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIN1Q05586 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIN1Q05586 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRIN1Q05586 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRIN1Q05586 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRIN1Q05586 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRIN1Q05586 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRIN1Q05586 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GRIN1Q05586 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GRIN1Q05586 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GRIN1Q05586 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
GRIN1Q05586 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GRIN1Q05586 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GRIN1Q05586 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GRIN1Q05586 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GRIN1Q05586 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GRIN1Q05586 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIN1Q05586 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIN1Q05586 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIN1Q05586 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIN1Q05586 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIN1Q05586 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIN1Q05586 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIN1Q05586 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIN1Q05586 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIN1Q05586 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIN1Q05586 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIN1Q05586 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIN1Q05586 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIN1Q05586 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIN1Q05586 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIN1Q05586 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIN1Q05586 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIN1Q05586 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIN1Q05586 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIN1Q05586 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIN1Q05586 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIN1Q05586 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIN1Q05586 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIN1Q05586 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIN1Q05586 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIN1Q05586 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIN1Q05586 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIN1Q05586 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIN1Q05586 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIN1Q05586 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIN1Q05586 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIN1Q05586 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIN1Q05586 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIN1Q05586 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIN1Q05586 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIN1Q05586 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIN1Q05586 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIN1Q05586 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIN1Q05586 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms