Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SSBP1Q04837 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SSBP1Q04837 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SSBP1Q04837 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SSBP1Q04837 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SSBP1Q04837 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SSBP1Q04837 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SSBP1Q04837 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SSBP1Q04837 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SSBP1Q04837 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SSBP1Q04837 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SSBP1Q04837 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SSBP1Q04837 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SSBP1Q04837 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SSBP1Q04837 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SSBP1Q04837 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SSBP1Q04837 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SSBP1Q04837 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SSBP1Q04837 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SSBP1Q04837 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SSBP1Q04837 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SSBP1Q04837 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SSBP1Q04837 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SSBP1Q04837 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SSBP1Q04837 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SSBP1Q04837 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SSBP1Q04837 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSBP1Q04837 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSBP1Q04837 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSBP1Q04837 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSBP1Q04837 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSBP1Q04837 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSBP1Q04837 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSBP1Q04837 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSBP1Q04837 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSBP1Q04837 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSBP1Q04837 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSBP1Q04837 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSBP1Q04837 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSBP1Q04837 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSBP1Q04837 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSBP1Q04837 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSBP1Q04837 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSBP1Q04837 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSBP1Q04837 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSBP1Q04837 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSBP1Q04837 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSBP1Q04837 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSBP1Q04837 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSBP1Q04837 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSBP1Q04837 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSBP1Q04837 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSBP1Q04837 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSBP1Q04837 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSBP1Q04837 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSBP1Q04837 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSBP1Q04837 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSBP1Q04837 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSBP1Q04837 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SSBP1Q04837 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSBP1Q04837 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSBP1Q04837 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSBP1Q04837 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSBP1Q04837 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSBP1Q04837 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSBP1Q04837 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSBP1Q04837 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSBP1Q04837 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSBP1Q04837 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SSBP1Q04837 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SSBP1Q04837 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SSBP1Q04837 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SSBP1Q04837 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SSBP1Q04837 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SSBP1Q04837 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SSBP1Q04837 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SSBP1Q04837 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SSBP1Q04837 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SSBP1Q04837 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SSBP1Q04837 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SSBP1Q04837 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SSBP1Q04837 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSBP1Q04837 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSBP1Q04837 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSBP1Q04837 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSBP1Q04837 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSBP1Q04837 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSBP1Q04837 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSBP1Q04837 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSBP1Q04837 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSBP1Q04837 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSBP1Q04837 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSBP1Q04837 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSBP1Q04837 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSBP1Q04837 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSBP1Q04837 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSBP1Q04837 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSBP1Q04837 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSBP1Q04837 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSBP1Q04837 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms