Protein–RNA interactions for Protein: Q04727

TLE4, Transducin-like enhancer protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLE4Q04727 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TLE4Q04727 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TLE4Q04727 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TLE4Q04727 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TLE4Q04727 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TLE4Q04727 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TLE4Q04727 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TLE4Q04727 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TLE4Q04727 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TLE4Q04727 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TLE4Q04727 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TLE4Q04727 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TLE4Q04727 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TLE4Q04727 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TLE4Q04727 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TLE4Q04727 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TLE4Q04727 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TLE4Q04727 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TLE4Q04727 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TLE4Q04727 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TLE4Q04727 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TLE4Q04727 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TLE4Q04727 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TLE4Q04727 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TLE4Q04727 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TLE4Q04727 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TLE4Q04727 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TLE4Q04727 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TLE4Q04727 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TLE4Q04727 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TLE4Q04727 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TLE4Q04727 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TLE4Q04727 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TLE4Q04727 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TLE4Q04727 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TLE4Q04727 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TLE4Q04727 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TLE4Q04727 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TLE4Q04727 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TLE4Q04727 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TLE4Q04727 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TLE4Q04727 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TLE4Q04727 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TLE4Q04727 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TLE4Q04727 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TLE4Q04727 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TLE4Q04727 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TLE4Q04727 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TLE4Q04727 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TLE4Q04727 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TLE4Q04727 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TLE4Q04727 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TLE4Q04727 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TLE4Q04727 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TLE4Q04727 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TLE4Q04727 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TLE4Q04727 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TLE4Q04727 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TLE4Q04727 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TLE4Q04727 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TLE4Q04727 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TLE4Q04727 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TLE4Q04727 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TLE4Q04727 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TLE4Q04727 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TLE4Q04727 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TLE4Q04727 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TLE4Q04727 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TLE4Q04727 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TLE4Q04727 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TLE4Q04727 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TLE4Q04727 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TLE4Q04727 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TLE4Q04727 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TLE4Q04727 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TLE4Q04727 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TLE4Q04727 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TLE4Q04727 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TLE4Q04727 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TLE4Q04727 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TLE4Q04727 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TLE4Q04727 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TLE4Q04727 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TLE4Q04727 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TLE4Q04727 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TLE4Q04727 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TLE4Q04727 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TLE4Q04727 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TLE4Q04727 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TLE4Q04727 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TLE4Q04727 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TLE4Q04727 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TLE4Q04727 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TLE4Q04727 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TLE4Q04727 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TLE4Q04727 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TLE4Q04727 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TLE4Q04727 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TLE4Q04727 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TLE4Q04727 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms