Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RELAQ04206 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RELAQ04206 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RELAQ04206 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RELAQ04206 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RELAQ04206 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RELAQ04206 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RELAQ04206 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RELAQ04206 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RELAQ04206 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RELAQ04206 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RELAQ04206 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RELAQ04206 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RELAQ04206 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RELAQ04206 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RELAQ04206 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RELAQ04206 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RELAQ04206 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RELAQ04206 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RELAQ04206 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RELAQ04206 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RELAQ04206 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RELAQ04206 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RELAQ04206 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RELAQ04206 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RELAQ04206 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RELAQ04206 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RELAQ04206 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RELAQ04206 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RELAQ04206 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RELAQ04206 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RELAQ04206 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RELAQ04206 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RELAQ04206 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RELAQ04206 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RELAQ04206 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RELAQ04206 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RELAQ04206 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RELAQ04206 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RELAQ04206 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RELAQ04206 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RELAQ04206 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RELAQ04206 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RELAQ04206 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RELAQ04206 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RELAQ04206 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RELAQ04206 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RELAQ04206 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RELAQ04206 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RELAQ04206 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RELAQ04206 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RELAQ04206 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RELAQ04206 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RELAQ04206 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RELAQ04206 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RELAQ04206 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RELAQ04206 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RELAQ04206 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RELAQ04206 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RELAQ04206 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RELAQ04206 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RELAQ04206 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RELAQ04206 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RELAQ04206 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RELAQ04206 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RELAQ04206 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RELAQ04206 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RELAQ04206 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RELAQ04206 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RELAQ04206 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RELAQ04206 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RELAQ04206 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RELAQ04206 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RELAQ04206 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RELAQ04206 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RELAQ04206 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RELAQ04206 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RELAQ04206 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RELAQ04206 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RELAQ04206 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RELAQ04206 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RELAQ04206 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RELAQ04206 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RELAQ04206 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RELAQ04206 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RELAQ04206 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RELAQ04206 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RELAQ04206 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RELAQ04206 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RELAQ04206 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RELAQ04206 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RELAQ04206 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RELAQ04206 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RELAQ04206 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RELAQ04206 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RELAQ04206 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RELAQ04206 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RELAQ04206 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RELAQ04206 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RELAQ04206 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms