Protein–RNA interactions for Protein: Q03654

CEF1, Pre-mRNA-splicing factor CEF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CEF1Q03654 YNG1YOR064C 660 nt5.86□□□□□ -1.47
CEF1Q03654 YBR230W-AYBR230W-A 201 nt5.86□□□□□ -1.47
CEF1Q03654 CTF18YMR078C 2226 nt5.86□□□□□ -1.47
CEF1Q03654 GIR2YDR152W 798 nt5.85□□□□□ -1.47
CEF1Q03654 RMD5YDR255C 1266 nt5.85□□□□□ -1.47
CEF1Q03654 DSD1YGL196W 1287 nt5.85□□□□□ -1.47
CEF1Q03654 PGU1YJR153W 1086 nt5.85□□□□□ -1.47
CEF1Q03654 YLR283WYLR283W 945 nt5.85□□□□□ -1.47
CEF1Q03654 YMR082CYMR082C 357 nt5.85□□□□□ -1.47
CEF1Q03654 YOL097W-AYOL097W-A 186 nt5.85□□□□□ -1.47
CEF1Q03654 HST1YOL068C 1512 nt5.84□□□□□ -1.47
CEF1Q03654 VHS2YIL135C 1311 nt5.84□□□□□ -1.47
CEF1Q03654 YDL034WYDL034W 345 nt5.84□□□□□ -1.47
CEF1Q03654 PEX19YDL065C 1029 nt5.84□□□□□ -1.47
CEF1Q03654 LSM6YDR378C 261 nt5.84□□□□□ -1.47
CEF1Q03654 LNP1YHR192W 837 nt5.84□□□□□ -1.47
CEF1Q03654 NVJ1YHR195W 966 nt5.84□□□□□ -1.47
CEF1Q03654 XPT1YJR133W 630 nt5.84□□□□□ -1.47
CEF1Q03654 YLR296WYLR296W 327 nt5.84□□□□□ -1.47
CEF1Q03654 YLR317WYLR317W 435 nt5.84□□□□□ -1.47
CEF1Q03654 NFI1YOR156C 2181 nt5.84□□□□□ -1.47
CEF1Q03654 HPC2YBR215W 1878 nt5.83□□□□□ -1.48
CEF1Q03654 ENT2YLR206W 1842 nt5.83□□□□□ -1.48
CEF1Q03654 BAP2YBR068C 1830 nt5.83□□□□□ -1.48
CEF1Q03654 MNN2YBR015C 1794 nt5.83□□□□□ -1.48
CEF1Q03654 DBF4YDR052C 2115 nt5.83□□□□□ -1.48
CEF1Q03654 PFA5YDR459C 1125 nt5.83□□□□□ -1.48
CEF1Q03654 Q0144Q0144 330 nt5.83□□□□□ -1.48
CEF1Q03654 OMA1YKR087C 1038 nt5.83□□□□□ -1.48
CEF1Q03654 SNO1YMR095C 675 nt5.83□□□□□ -1.48
CEF1Q03654 RPS15YOL040C 429 nt5.83□□□□□ -1.48
CEF1Q03654 OAZ1YPL052W 879 nt5.83□□□□□ -1.48
CEF1Q03654 NOT3YIL038C 2511 nt5.83□□□□□ -1.48
CEF1Q03654 RSC30YHR056C 2652 nt5.82□□□□□ -1.48
CEF1Q03654 TMN2YDR107C 2019 nt5.82□□□□□ -1.48
CEF1Q03654 TFG1YGR186W 2208 nt5.82□□□□□ -1.48
CEF1Q03654 CNL1YDR357C 369 nt5.82□□□□□ -1.48
CEF1Q03654 CHO1YER026C 831 nt5.82□□□□□ -1.48
CEF1Q03654 PPA2YMR267W 933 nt5.82□□□□□ -1.48
CEF1Q03654 YOL024WYOL024W 519 nt5.82□□□□□ -1.48
CEF1Q03654 UBC4YBR082C 447 nt5.82□□□□□ -1.48
CEF1Q03654 BDP1YNL039W 1785 nt5.82□□□□□ -1.48
CEF1Q03654 RET1YOR207C 3450 nt5.81□□□□□ -1.48
CEF1Q03654 COS4YFL062W 1140 nt5.81□□□□□ -1.48
CEF1Q03654 COS3YML132W 1140 nt5.81□□□□□ -1.48
CEF1Q03654 COS2YBR302C 1140 nt5.81□□□□□ -1.48
CEF1Q03654 AIM10YER087W 1731 nt5.81□□□□□ -1.48
CEF1Q03654 RFT1YBL020W 1725 nt5.81□□□□□ -1.48
CEF1Q03654 GEP3YOR205C 1671 nt5.81□□□□□ -1.48
CEF1Q03654 TOS4YLR183C 1470 nt5.8□□□□□ -1.48
CEF1Q03654 YER133W-AYER133W-A 342 nt5.8□□□□□ -1.48
CEF1Q03654 MOB2YFL034C-B 864 nt5.8□□□□□ -1.48
CEF1Q03654 YJL193WYJL193W 1209 nt5.8□□□□□ -1.48
CEF1Q03654 YLR311CYLR311C 348 nt5.8□□□□□ -1.48
CEF1Q03654 SEC12YNR026C 1416 nt5.8□□□□□ -1.48
CEF1Q03654 ALD6YPL061W 1503 nt5.79□□□□□ -1.48
CEF1Q03654 GAS2YLR343W 1668 nt5.79□□□□□ -1.48
CEF1Q03654 YDL241WYDL241W 372 nt5.79□□□□□ -1.48
CEF1Q03654 MAF1YDR005C 1188 nt5.79□□□□□ -1.48
CEF1Q03654 MCM21YDR318W 1107 nt5.79□□□□□ -1.48
CEF1Q03654 MLC1YGL106W 450 nt5.79□□□□□ -1.48
CEF1Q03654 CAX4YGR036C 720 nt5.79□□□□□ -1.48
CEF1Q03654 PEX22YAL055W 543 nt5.79□□□□□ -1.48
CEF1Q03654 YLL059CYLL059C 507 nt5.79□□□□□ -1.48
CEF1Q03654 SED5YLR026C 1023 nt5.79□□□□□ -1.48
CEF1Q03654 RPS31YLR167W 459 nt5.79□□□□□ -1.48
CEF1Q03654 MRC1YCL061C 3291 nt5.78□□□□□ -1.48
CEF1Q03654 ERV14YGL054C 417 nt5.78□□□□□ -1.48
CEF1Q03654 TIM21YGR033C 720 nt5.78□□□□□ -1.48
CEF1Q03654 DAL3YIR032C 588 nt5.78□□□□□ -1.48
CEF1Q03654 YLR412C-AYLR412C-A 207 nt5.78□□□□□ -1.48
CEF1Q03654 CUS2YNL286W 858 nt5.78□□□□□ -1.48
CEF1Q03654 CBC2YPL178W 627 nt5.78□□□□□ -1.48
CEF1Q03654 NAT3YPR131C 588 nt5.78□□□□□ -1.48
CEF1Q03654 TOS3YGL179C 1683 nt5.78□□□□□ -1.48
CEF1Q03654 DED81YHR019C 1665 nt5.78□□□□□ -1.48
CEF1Q03654 ALD3YMR169C 1521 nt5.78□□□□□ -1.48
CEF1Q03654 ALD2YMR170C 1521 nt5.78□□□□□ -1.48
CEF1Q03654 TEF1YPR080W 1377 nt5.78□□□□□ -1.48
CEF1Q03654 TEF2YBR118W 1377 nt5.78□□□□□ -1.48
CEF1Q03654 MOT2YER068W 1764 nt5.78□□□□□ -1.48
CEF1Q03654 GAS5YOL030W 1455 nt5.77□□□□□ -1.49
CEF1Q03654 CAB3YKL088W 1716 nt5.77□□□□□ -1.49
CEF1Q03654 RAT1YOR048C 3021 nt5.77□□□□□ -1.49
CEF1Q03654 SPR28YDR218C 1272 nt5.77□□□□□ -1.49
CEF1Q03654 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt5.77□□□□□ -1.49
CEF1Q03654 YHR127WYHR127W 732 nt5.77□□□□□ -1.49
CEF1Q03654 YLR118CYLR118C 684 nt5.77□□□□□ -1.49
CEF1Q03654 RAD17YOR368W 1206 nt5.77□□□□□ -1.49
CEF1Q03654 ZRC1YMR243C 1329 nt5.76□□□□□ -1.49
CEF1Q03654 ERG4YGL012W 1422 nt5.76□□□□□ -1.49
CEF1Q03654 PXA1YPL147W 2613 nt5.76□□□□□ -1.49
CEF1Q03654 ARP2YDL029W 1176 nt5.76□□□□□ -1.49
CEF1Q03654 GCV1YDR019C 1203 nt5.76□□□□□ -1.49
CEF1Q03654 YER085CYER085C 522 nt5.76□□□□□ -1.49
CEF1Q03654 PCT1YGR202C 1275 nt5.76□□□□□ -1.49
CEF1Q03654 YJR056CYJR056C 711 nt5.76□□□□□ -1.49
CEF1Q03654 RRP40YOL142W 723 nt5.76□□□□□ -1.49
CEF1Q03654 ESF1YDR365C 1887 nt5.76□□□□□ -1.49
CEF1Q03654 FUM1YPL262W 1467 nt5.76□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 26.4 ms