Protein–RNA interactions for Protein: Q03518

TAP1, Antigen peptide transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAP1Q03518 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TAP1Q03518 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TAP1Q03518 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TAP1Q03518 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TAP1Q03518 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TAP1Q03518 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TAP1Q03518 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TAP1Q03518 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TAP1Q03518 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TAP1Q03518 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TAP1Q03518 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TAP1Q03518 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TAP1Q03518 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TAP1Q03518 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TAP1Q03518 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TAP1Q03518 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TAP1Q03518 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TAP1Q03518 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TAP1Q03518 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TAP1Q03518 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TAP1Q03518 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TAP1Q03518 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TAP1Q03518 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TAP1Q03518 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TAP1Q03518 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TAP1Q03518 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TAP1Q03518 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TAP1Q03518 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TAP1Q03518 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TAP1Q03518 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TAP1Q03518 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TAP1Q03518 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TAP1Q03518 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TAP1Q03518 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TAP1Q03518 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TAP1Q03518 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TAP1Q03518 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TAP1Q03518 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TAP1Q03518 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TAP1Q03518 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TAP1Q03518 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TAP1Q03518 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAP1Q03518 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAP1Q03518 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAP1Q03518 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAP1Q03518 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAP1Q03518 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAP1Q03518 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAP1Q03518 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TAP1Q03518 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAP1Q03518 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAP1Q03518 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TAP1Q03518 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TAP1Q03518 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TAP1Q03518 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TAP1Q03518 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TAP1Q03518 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TAP1Q03518 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TAP1Q03518 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TAP1Q03518 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TAP1Q03518 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TAP1Q03518 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TAP1Q03518 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TAP1Q03518 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TAP1Q03518 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TAP1Q03518 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TAP1Q03518 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TAP1Q03518 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TAP1Q03518 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TAP1Q03518 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TAP1Q03518 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TAP1Q03518 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TAP1Q03518 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TAP1Q03518 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TAP1Q03518 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TAP1Q03518 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TAP1Q03518 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TAP1Q03518 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TAP1Q03518 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TAP1Q03518 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TAP1Q03518 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TAP1Q03518 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TAP1Q03518 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TAP1Q03518 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TAP1Q03518 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TAP1Q03518 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TAP1Q03518 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TAP1Q03518 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TAP1Q03518 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TAP1Q03518 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TAP1Q03518 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TAP1Q03518 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TAP1Q03518 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TAP1Q03518 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TAP1Q03518 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TAP1Q03518 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TAP1Q03518 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TAP1Q03518 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TAP1Q03518 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TAP1Q03518 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms