Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DSG1Q02413 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DSG1Q02413 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
DSG1Q02413 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DSG1Q02413 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DSG1Q02413 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DSG1Q02413 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DSG1Q02413 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DSG1Q02413 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DSG1Q02413 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DSG1Q02413 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DSG1Q02413 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
DSG1Q02413 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DSG1Q02413 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DSG1Q02413 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DSG1Q02413 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DSG1Q02413 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DSG1Q02413 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DSG1Q02413 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DSG1Q02413 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DSG1Q02413 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DSG1Q02413 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DSG1Q02413 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DSG1Q02413 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DSG1Q02413 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DSG1Q02413 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DSG1Q02413 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DSG1Q02413 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DSG1Q02413 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DSG1Q02413 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DSG1Q02413 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DSG1Q02413 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DSG1Q02413 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DSG1Q02413 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DSG1Q02413 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
DSG1Q02413 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
DSG1Q02413 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DSG1Q02413 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
DSG1Q02413 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DSG1Q02413 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DSG1Q02413 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
DSG1Q02413 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DSG1Q02413 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DSG1Q02413 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DSG1Q02413 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DSG1Q02413 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DSG1Q02413 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DSG1Q02413 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DSG1Q02413 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DSG1Q02413 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DSG1Q02413 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DSG1Q02413 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DSG1Q02413 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DSG1Q02413 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DSG1Q02413 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DSG1Q02413 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DSG1Q02413 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DSG1Q02413 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DSG1Q02413 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DSG1Q02413 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DSG1Q02413 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DSG1Q02413 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DSG1Q02413 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DSG1Q02413 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DSG1Q02413 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
DSG1Q02413 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DSG1Q02413 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DSG1Q02413 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DSG1Q02413 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DSG1Q02413 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DSG1Q02413 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DSG1Q02413 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DSG1Q02413 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DSG1Q02413 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DSG1Q02413 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DSG1Q02413 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DSG1Q02413 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DSG1Q02413 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DSG1Q02413 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DSG1Q02413 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DSG1Q02413 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
DSG1Q02413 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DSG1Q02413 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DSG1Q02413 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DSG1Q02413 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DSG1Q02413 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DSG1Q02413 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DSG1Q02413 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DSG1Q02413 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DSG1Q02413 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DSG1Q02413 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DSG1Q02413 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DSG1Q02413 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DSG1Q02413 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DSG1Q02413 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DSG1Q02413 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DSG1Q02413 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DSG1Q02413 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DSG1Q02413 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DSG1Q02413 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms